More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0108 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 646 aa  637    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_002936  DET0753  threonyl-tRNA synthetase  55.23 
 
 		 582 aa  640    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.105849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 636 aa  644    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 		 636 aa  653    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  63.71 
 
 		 637 aa  843    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 637 aa  649    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 		 644 aa  698    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 662 aa  658    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 614 aa  638    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 652 aa  657    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 644 aa  697    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  55.57 
 
 		 582 aa  645    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000323411  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 		 638 aa  664    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 645 aa  648    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 		 644 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 		 644 aa  698    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 635 aa  676    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 		 636 aa  660    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 659 aa  668    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 649 aa  642    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 644 aa  658    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  49.44 
 
 		 645 aa  648    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 643 aa  1311    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  53.34 
 
 		 638 aa  711    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 635 aa  664    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 		 643 aa  690    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 		 648 aa  712    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 638 aa  665    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 636 aa  655    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  55.75 
 
 		 582 aa  650    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 		 634 aa  658    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 640 aa  658    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 644 aa  642    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 636 aa  649    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 640 aa  660    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 639 aa  632  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  53.53 
 
 		 638 aa  632  1e-180  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 635 aa  634  1e-180  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 646 aa  634  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 645 aa  629  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 645 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 645 aa  630  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 639 aa  628  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 645 aa  630  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 645 aa  628  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 645 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 645 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 633 aa  629  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 645 aa  629  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 643 aa  627  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 640 aa  626  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 639 aa  626  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 645 aa  627  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 634 aa  625  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 639 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 644 aa  628  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 639 aa  625  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 635 aa  624  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 640 aa  624  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 639 aa  625  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 639 aa  624  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 649 aa  624  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 645 aa  624  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 640 aa  622  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 645 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 639 aa  619  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 635 aa  621  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 645 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 640 aa  620  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 644 aa  618  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 644 aa  616  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 637 aa  613  9.999999999999999e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 645 aa  609  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 657 aa  611  1e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 583 aa  610  1e-173  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 639 aa  611  1e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 645 aa  609  1e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0744  threonyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 		 581 aa  610  1e-173  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0359075  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 647 aa  606  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 631 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 640 aa  604  1.0000000000000001e-171  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 641 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1192  threonyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 652 aa  602  1.0000000000000001e-171  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 634 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 633 aa  598  1e-170  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 657 aa  599  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 		 640 aa  599  1e-170  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 642 aa  601  1e-170  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_46103  predicted protein  53 
 
 		 564 aa  600  1e-170  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.036188 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 		 596 aa  600  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 638 aa  596  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33493  predicted protein  49.24 
 
 		 684 aa  596  1e-169  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0081  threonyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 605 aa  595  1e-169  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000716431  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 659 aa  595  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 635 aa  598  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2095  threonyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 684 aa  594  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00031634  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 644 aa  593  1e-168  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 		 641 aa  594  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 636 aa  593  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 		 675 aa  593  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>