More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1192 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1192  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
652 aa  1337    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
645 aa  637    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 
652 aa  648    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
645 aa  637    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0982  threonyl-tRNA synthetase  80.52 
 
 
652 aa  1085    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0768948  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  50.38 
 
 
649 aa  668    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
644 aa  650    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  55.4 
 
 
596 aa  642    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
648 aa  636    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 
643 aa  627  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 
645 aa  622  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 
645 aa  622  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 
645 aa  623  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
645 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
645 aa  624  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
645 aa  624  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
645 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 
645 aa  622  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 
645 aa  622  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
645 aa  624  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 
645 aa  618  1e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 
639 aa  615  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
643 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
662 aa  602  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
648 aa  599  1e-170  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
638 aa  594  1e-168  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 
657 aa  593  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 
636 aa  590  1e-167  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
646 aa  589  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
637 aa  587  1e-166  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
648 aa  585  1e-166  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 
638 aa  576  1.0000000000000001e-163  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 
657 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 
644 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 
657 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 
644 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  44 
 
 
659 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 
644 aa  570  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 
677 aa  571  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
640 aa  569  1e-161  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
643 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 
640 aa  572  1e-161  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
647 aa  567  1e-160  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 
659 aa  567  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
636 aa  568  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 
641 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
653 aa  561  1e-158  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
657 aa  560  1e-158  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 
645 aa  561  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 
636 aa  560  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 
675 aa  560  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 
636 aa  556  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 
647 aa  555  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 
636 aa  557  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
635 aa  555  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
645 aa  555  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0992  threonyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 
647 aa  554  1e-156  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
647 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 
645 aa  550  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
648 aa  551  1e-155  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 
604 aa  549  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
639 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
639 aa  546  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2078  threonyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 
657 aa  545  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
639 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
639 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
644 aa  548  1e-154  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 
638 aa  543  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
640 aa  543  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
639 aa  544  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 
633 aa  542  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 
647 aa  544  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
635 aa  545  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
639 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 
640 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
636 aa  540  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 
635 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
634 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3269  threonyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
657 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 
646 aa  536  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 
637 aa  538  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  42 
 
 
639 aa  538  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 
637 aa  536  1e-151  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 
635 aa  537  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
646 aa  537  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0110  threonyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 
595 aa  538  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 
640 aa  537  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6132  threonyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
659 aa  537  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158599  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
640 aa  538  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2181  threonyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 
646 aa  538  1e-151  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3025  threonyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
638 aa  535  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 
637 aa  535  1e-150  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 
635 aa  532  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
637 aa  533  1e-150  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
639 aa  535  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0662  threonyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
652 aa  533  1e-150  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 
635 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 
635 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
635 aa  529  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 
635 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>