More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0516 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  63.71 
 
 		 643 aa  857    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 643 aa  641    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 644 aa  647    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 638 aa  642    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 637 aa  1301    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 		 648 aa  655    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 		 644 aa  629  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 		 644 aa  629  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 636 aa  622  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 		 636 aa  615  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 		 636 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 659 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 		 652 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 636 aa  610  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 		 645 aa  610  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 645 aa  610  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 638 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 644 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 645 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 645 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 645 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 645 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 645 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 583 aa  603  1.0000000000000001e-171  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 646 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 645 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 645 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 645 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 		 645 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 649 aa  604  1.0000000000000001e-171  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 645 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 		 635 aa  600  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 639 aa  601  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 637 aa  599  1e-170  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 		 640 aa  599  1e-170  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 636 aa  601  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 638 aa  599  1e-170  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 		 640 aa  599  1e-170  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 643 aa  597  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1192  threonyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 652 aa  595  1e-169  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 		 646 aa  592  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 635 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0982  threonyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 652 aa  592  1e-168  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0768948  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 644 aa  594  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 644 aa  589  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 		 638 aa  590  1e-167  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0744  threonyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 		 581 aa  590  1e-167  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 644 aa  588  1e-167  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 614 aa  588  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 		 637 aa  585  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 635 aa  587  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 638 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 639 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 639 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 639 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 582 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000323411  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0753  threonyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 582 aa  578  1e-164  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.105849  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 662 aa  579  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 649 aa  579  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 644 aa  580  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 633 aa  578  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  48.8 
 
 		 582 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 639 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 639 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 634 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 639 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 640 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 644 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 640 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 640 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 641 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 645 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 		 644 aa  575  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1819  threonyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 606 aa  568  1e-161  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.196151  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 635 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 640 aa  570  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 640 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 		 643 aa  568  1e-160  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 642 aa  566  1e-160  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 639 aa  568  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 635 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 634 aa  568  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 635 aa  564  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 657 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3623  threonyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 643 aa  564  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 		 647 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 		 635 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 639 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 635 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 640 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 653 aa  559  1e-158  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 657 aa  561  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 645 aa  561  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1967  threonyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 640 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134711  normal  0.0132251 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 635 aa  560  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1638  threonyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 660 aa  559  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.360122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 638 aa  559  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 669 aa  558  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 647 aa  560  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 645 aa  561  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>