More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0992 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 653 aa  1350    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  63.08 
 
 		 662 aa  831    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  68.44 
 
 		 641 aa  936    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  65.57 
 
 		 647 aa  881    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  67.5 
 
 		 646 aa  938    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  61.67 
 
 		 648 aa  837    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 		 677 aa  696    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 		 657 aa  697    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 643 aa  637    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  66.51 
 
 		 647 aa  892    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 657 aa  685    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 		 649 aa  679    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  62.46 
 
 		 644 aa  847    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  65.79 
 
 		 645 aa  921    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0992  threonyl-tRNA synthetase  64.13 
 
 		 647 aa  847    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0024  threonyl-tRNA synthetase  62.71 
 
 		 648 aa  847    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 657 aa  689    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 		 657 aa  690    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 		 675 aa  691    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  51.39 
 
 		 659 aa  700    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 645 aa  629  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 645 aa  629  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 652 aa  630  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 645 aa  629  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 644 aa  628  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 645 aa  628  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 645 aa  628  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 645 aa  628  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 645 aa  628  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 645 aa  628  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 645 aa  628  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 645 aa  627  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 648 aa  620  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 604 aa  613  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  49.44 
 
 		 645 aa  609  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 633 aa  611  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 638 aa  610  1e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 634 aa  610  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 635 aa  609  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 647 aa  606  9.999999999999999e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 634 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 		 635 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 638 aa  605  9.999999999999999e-173  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 645 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 643 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 639 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 645 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 639 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 635 aa  600  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  52.21 
 
 		 596 aa  598  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 648 aa  601  1e-170  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 636 aa  597  1e-169  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 644 aa  597  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 644 aa  597  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4204  threonyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 736 aa  596  1e-169  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 635 aa  595  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 		 643 aa  593  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 635 aa  593  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 645 aa  593  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1732  threonyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 630 aa  591  1e-167  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 637 aa  589  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 639 aa  586  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 639 aa  586  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 639 aa  586  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 639 aa  585  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 639 aa  586  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0387  threonyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 610 aa  585  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.677095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 639 aa  586  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 640 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 659 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 640 aa  581  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 640 aa  580  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 639 aa  581  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 640 aa  580  1e-164  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 638 aa  581  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 648 aa  580  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 640 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 636 aa  575  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 645 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2606  threonyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 604 aa  575  1.0000000000000001e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0580419 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 640 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 636 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 642 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1457  threonyl-tRNA synthetase  50.95 
 
 		 608 aa  573  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 		 636 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 640 aa  570  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 644 aa  569  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 		 635 aa  569  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 637 aa  568  1e-161  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 635 aa  568  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 635 aa  568  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 635 aa  568  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 640 aa  565  1e-160  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 608 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 635 aa  568  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 635 aa  568  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 635 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 635 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 635 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 635 aa  568  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>