More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2850 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0349  threonyl-tRNA synthetase  58.67 
 
 
595 aa  717    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129605  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0760  threonyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 
607 aa  684    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.281808  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2841  threonyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 
606 aa  655    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2511  threonyl-tRNA synthetase  56.93 
 
 
594 aa  688    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0678043  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2787  threonyl-tRNA synthetase  54.8 
 
 
615 aa  678    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100504  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 
608 aa  698    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  57.22 
 
 
662 aa  663    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2606  threonyl-tRNA synthetase  54.65 
 
 
604 aa  677    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0580419 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0731  threonyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 
607 aa  684    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 
646 aa  653    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0387  threonyl-tRNA synthetase  55.54 
 
 
610 aa  681    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.677095  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
604 aa  1239    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1457  threonyl-tRNA synthetase  54.14 
 
 
608 aa  662    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0110  threonyl-tRNA synthetase  59.67 
 
 
595 aa  726    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  55.8 
 
 
596 aa  689    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 
649 aa  633  1e-180  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 
645 aa  632  1e-180  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  53.73 
 
 
647 aa  628  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 
648 aa  625  1e-178  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 
641 aa  622  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0992  threonyl-tRNA synthetase  54.92 
 
 
647 aa  624  1e-177  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  51.25 
 
 
647 aa  611  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2483  threonyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 
637 aa  607  9.999999999999999e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0764303  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0024  threonyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 
648 aa  603  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 
653 aa  600  1e-170  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2095  threonyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 
684 aa  600  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00031634  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
657 aa  600  1e-170  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4204  threonyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
736 aa  596  1e-169  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 
675 aa  595  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 
657 aa  593  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 
644 aa  589  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 
635 aa  591  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 
639 aa  590  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2078  threonyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 
657 aa  590  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
643 aa  585  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 
644 aa  585  1e-166  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
657 aa  586  1e-166  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1732  threonyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
630 aa  583  1.0000000000000001e-165  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3269  threonyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 
657 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
677 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
652 aa  579  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
582 aa  580  1e-164  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000323411  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 
614 aa  579  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 
644 aa  580  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  50.79 
 
 
582 aa  580  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0753  threonyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
582 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.105849  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 
659 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
635 aa  578  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 
657 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2230  threonyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 
666 aa  574  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883238  hitchhiker  0.00000834751 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1764  threonyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
658 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279145  hitchhiker  0.00103927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2108  threonyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
659 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
659 aa  573  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
636 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
643 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 
636 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12633  threonyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
692 aa  568  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167606  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
644 aa  570  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
644 aa  570  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
638 aa  567  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2089  threonyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
682 aa  567  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 
637 aa  566  1e-160  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3147  threonyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
701 aa  568  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3838  threonyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 
695 aa  565  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.400381  normal  0.082381 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 
635 aa  565  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 
648 aa  568  1e-160  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3188  threonyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
690 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 
648 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
645 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
583 aa  564  1.0000000000000001e-159  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 
648 aa  565  1.0000000000000001e-159  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 
644 aa  562  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 
645 aa  560  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 
639 aa  558  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 
649 aa  560  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 
644 aa  561  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
633 aa  559  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1783  threonyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 
670 aa  560  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.0885436 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 
645 aa  558  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13900  threonyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 
666 aa  559  1e-158  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0274631  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2370  threonyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 
668 aa  561  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 
645 aa  558  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 
647 aa  558  1e-157  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6132  threonyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 
659 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158599  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 
643 aa  558  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 
640 aa  557  1e-157  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2281  threonyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 
684 aa  558  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
634 aa  556  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0841  threonine--tRNA ligase  47.99 
 
 
676 aa  556  1e-157  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
646 aa  556  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2242  threonyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 
684 aa  558  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1358  threonyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 
685 aa  556  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.462189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3066  threonyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 
656 aa  556  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.408536  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2289  threonyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 
684 aa  558  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45784  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2558  threonyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 
691 aa  557  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 
645 aa  554  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 
645 aa  553  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 
645 aa  553  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 
645 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 
645 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>