More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0559 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  62.46 
 
 
653 aa  831    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  67.61 
 
 
641 aa  932    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 
657 aa  688    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  51.55 
 
 
677 aa  694    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
657 aa  682    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
644 aa  1334    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0024  threonyl-tRNA synthetase  62.2 
 
 
648 aa  821    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  67.08 
 
 
646 aa  926    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 
659 aa  696    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 
657 aa  694    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  62.21 
 
 
662 aa  851    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  67.34 
 
 
647 aa  927    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  67.83 
 
 
647 aa  916    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  67.92 
 
 
645 aa  947    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0992  threonyl-tRNA synthetase  62.44 
 
 
647 aa  828    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  64.32 
 
 
648 aa  861    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
657 aa  675    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 
675 aa  689    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
648 aa  625  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 
649 aa  626  1e-178  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 
645 aa  622  1e-177  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4204  threonyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
736 aa  615  1e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
645 aa  615  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
645 aa  615  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
648 aa  618  1e-175  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 
647 aa  613  9.999999999999999e-175  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
635 aa  610  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 
652 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
645 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
645 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
645 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
645 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
645 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 
633 aa  602  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 
644 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 
634 aa  601  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
645 aa  600  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 
645 aa  598  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 
643 aa  601  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
645 aa  600  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 
635 aa  600  1e-170  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 
636 aa  597  1e-169  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 
645 aa  597  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 
638 aa  594  1e-168  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
635 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 
645 aa  595  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 
643 aa  593  1e-168  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 
639 aa  589  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2483  threonyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
637 aa  585  1e-166  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0764303  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 
604 aa  585  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 
644 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 
644 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 
635 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
648 aa  584  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 
637 aa  580  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 
596 aa  579  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
659 aa  576  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
635 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
635 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 
636 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 
639 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
635 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
635 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
635 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 
638 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 
639 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
635 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
635 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
643 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
638 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 
644 aa  572  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
642 aa  571  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 
639 aa  570  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1732  threonyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 
630 aa  570  1e-161  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2181  threonyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 
646 aa  570  1e-161  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 
638 aa  568  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
640 aa  565  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 
639 aa  568  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 
639 aa  568  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 
639 aa  568  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 
645 aa  568  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
635 aa  568  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 
635 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
647 aa  567  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 
635 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 
640 aa  568  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
635 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 
640 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
640 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
635 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
635 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
635 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 
645 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 
635 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
635 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 
636 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 
639 aa  560  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 
635 aa  561  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
640 aa  560  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 
640 aa  561  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>