More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1383 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0731  threonyl-tRNA synthetase  83.72 
 
 
607 aa  1063    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33493  predicted protein  52.09 
 
 
684 aa  656    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 
614 aa  660    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2787  threonyl-tRNA synthetase  82.89 
 
 
615 aa  1044    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100504  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0760  threonyl-tRNA synthetase  83.72 
 
 
607 aa  1063    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.281808  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0935  threonyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 
611 aa  718    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0867221  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1034  threonyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 
611 aa  706    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
608 aa  1251    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2606  threonyl-tRNA synthetase  79.93 
 
 
604 aa  1013    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0580419 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 
604 aa  698    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0387  threonyl-tRNA synthetase  79.44 
 
 
610 aa  1018    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.677095  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1457  threonyl-tRNA synthetase  80.61 
 
 
608 aa  1011    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2841  threonyl-tRNA synthetase  80.46 
 
 
606 aa  1015    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_46103  predicted protein  55.96 
 
 
564 aa  630  1e-179  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.036188 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 
662 aa  622  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 
596 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 
657 aa  611  1e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  51.04 
 
 
677 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  50.69 
 
 
657 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 
657 aa  599  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 
646 aa  596  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2483  threonyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
637 aa  592  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0764303  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 
657 aa  591  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
647 aa  590  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 
659 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 
649 aa  583  1.0000000000000001e-165  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
645 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 
675 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
641 aa  579  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4204  threonyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
736 aa  572  1.0000000000000001e-162  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 
643 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
648 aa  573  1.0000000000000001e-162  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
644 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
659 aa  568  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0110  threonyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
595 aa  566  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
583 aa  566  1e-160  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2511  threonyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 
594 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0678043  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
646 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 
638 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 
648 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1732  threonyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 
630 aa  563  1.0000000000000001e-159  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
644 aa  559  1e-158  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0349  threonyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
595 aa  558  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129605  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
653 aa  556  1e-157  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 
638 aa  556  1e-157  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 
643 aa  556  1e-157  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
649 aa  555  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
652 aa  555  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 
647 aa  556  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
636 aa  554  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 
635 aa  552  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 
645 aa  554  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
643 aa  552  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0992  threonyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 
647 aa  552  1e-156  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2317  threonyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
669 aa  552  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 
645 aa  551  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 
645 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
636 aa  548  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 
645 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 
645 aa  549  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 
645 aa  549  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 
645 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 
645 aa  551  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 
645 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
639 aa  549  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 
645 aa  550  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 
645 aa  551  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 
648 aa  551  1e-155  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2043  threonyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 
669 aa  548  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000086336 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 
644 aa  547  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
646 aa  548  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
644 aa  546  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  46 
 
 
645 aa  546  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 
644 aa  547  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
636 aa  548  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 
643 aa  543  1e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
635 aa  541  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2095  threonyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 
684 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00031634  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 
644 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
633 aa  540  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2230  threonyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 
666 aa  540  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883238  hitchhiker  0.00000834751 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2078  threonyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
657 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 
648 aa  538  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0024  threonyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 
648 aa  536  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
638 aa  537  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
635 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 
647 aa  538  1e-151  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
644 aa  537  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2281  threonyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
684 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 
644 aa  538  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3269  threonyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
657 aa  537  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2242  threonyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
684 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2289  threonyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
684 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45784  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 
645 aa  538  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 
645 aa  538  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 
647 aa  533  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
635 aa  532  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 
641 aa  534  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6132  threonyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 
659 aa  532  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158599  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1373  threonyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
645 aa  532  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000340223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>