More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0613 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  64.12 
 
 
645 aa  867    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  64.74 
 
 
645 aa  880    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  63.38 
 
 
645 aa  840    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
640 aa  638    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 
640 aa  642    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  63.38 
 
 
645 aa  840    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  85.6 
 
 
647 aa  1183    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  57.36 
 
 
648 aa  769    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
639 aa  644    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  63.22 
 
 
645 aa  838    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 
639 aa  640    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  63.22 
 
 
645 aa  838    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  50.47 
 
 
639 aa  647    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  63.22 
 
 
645 aa  838    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  63.07 
 
 
645 aa  837    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  64.12 
 
 
645 aa  867    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1863  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  56.81 
 
 
601 aa  706    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
639 aa  644    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  63.22 
 
 
645 aa  838    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  65.01 
 
 
644 aa  888    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  55.94 
 
 
596 aa  673    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 
639 aa  640    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  63.22 
 
 
645 aa  838    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
646 aa  641    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 
639 aa  637    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 
639 aa  641    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
662 aa  660    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  65.02 
 
 
652 aa  879    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  63.58 
 
 
643 aa  847    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2181  threonyl-tRNA synthetase  74.15 
 
 
646 aa  1014    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0460  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  57.54 
 
 
663 aa  755    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0696284  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1415  threonyl-tRNA synthetase  58.01 
 
 
643 aa  782    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000260393 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0662  threonyl-tRNA synthetase  62.6 
 
 
652 aa  852    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
648 aa  1343    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  63.38 
 
 
645 aa  840    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  63.38 
 
 
645 aa  840    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 
646 aa  644    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
640 aa  634  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 
639 aa  630  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 
647 aa  625  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
640 aa  624  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 
645 aa  622  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 
640 aa  619  1e-176  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 
639 aa  621  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
647 aa  618  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 
640 aa  617  1e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
644 aa  618  1e-175  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 
635 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
638 aa  611  1e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 
635 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 
641 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 
648 aa  600  1e-170  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 
644 aa  597  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 
643 aa  597  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
633 aa  596  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 
647 aa  592  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 
634 aa  593  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 
659 aa  594  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2631  threonyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 
643 aa  592  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2317  threonyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 
643 aa  593  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
635 aa  593  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 
653 aa  589  1e-167  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1373  threonyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 
645 aa  589  1e-167  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000340223  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
643 aa  589  1e-167  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
637 aa  586  1e-166  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
637 aa  586  1e-166  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0992  threonyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 
647 aa  588  1e-166  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
642 aa  585  1e-166  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 
659 aa  585  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0626  threonyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 
580 aa  586  1e-166  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 
648 aa  587  1e-166  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 
657 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 
638 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
657 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0024  threonyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 
648 aa  585  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 
634 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
635 aa  580  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 
636 aa  579  1e-164  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
677 aa  581  1e-164  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
635 aa  580  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 
649 aa  581  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
657 aa  579  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 
645 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 
644 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1192  threonyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
652 aa  577  1.0000000000000001e-163  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 
633 aa  576  1.0000000000000001e-163  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 
644 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
636 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 
635 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 
644 aa  573  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 
657 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 
643 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 
636 aa  571  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02079  threonyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 
642 aa  572  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
636 aa  570  1e-161  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
635 aa  572  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
638 aa  570  1e-161  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 
675 aa  568  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2668  threonyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 
652 aa  570  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.107403  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
635 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>