More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1907 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 
635 aa  694    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 
636 aa  679    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 
640 aa  635    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
637 aa  1313    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 
639 aa  640    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 
639 aa  639    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 
639 aa  639    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 
640 aa  637    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 
643 aa  673    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 
644 aa  647    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 
636 aa  677    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  51.96 
 
 
638 aa  668    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
634 aa  666    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 
645 aa  686    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 
639 aa  640    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  53.04 
 
 
646 aa  660    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 
637 aa  649    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 
639 aa  646    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  50.47 
 
 
633 aa  655    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 
634 aa  651    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 
635 aa  663    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 
639 aa  639    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 
640 aa  658    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 
638 aa  678    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 
636 aa  675    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 
645 aa  681    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 
635 aa  660    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 
644 aa  638    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
639 aa  638    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 
648 aa  659    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 
644 aa  638    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 
636 aa  673    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 
640 aa  658    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 
639 aa  632  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 
640 aa  634  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 
636 aa  631  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
635 aa  631  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 
649 aa  628  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 
635 aa  627  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 
644 aa  627  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3623  threonyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 
643 aa  624  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 
635 aa  623  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
644 aa  624  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
640 aa  623  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
635 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 
635 aa  618  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
635 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
635 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
635 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 
643 aa  621  1e-176  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
635 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 
635 aa  620  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
635 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
635 aa  621  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
635 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
635 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
635 aa  621  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 
635 aa  616  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
635 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 
634 aa  618  1e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
635 aa  617  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 
669 aa  618  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 
635 aa  617  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 
636 aa  617  1e-175  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
635 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 
662 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
640 aa  613  9.999999999999999e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 
635 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 
635 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0028  threonyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 
603 aa  610  1e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 
635 aa  611  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3025  threonyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
638 aa  605  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 
638 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1870  threonyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 
635 aa  606  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47552  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
635 aa  608  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 
647 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 
644 aa  607  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1448  threonyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 
639 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 
638 aa  604  1.0000000000000001e-171  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
637 aa  603  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
635 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
642 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
639 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 
641 aa  604  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
646 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
644 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 
644 aa  604  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 
637 aa  600  1e-170  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 
640 aa  598  1e-170  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 
637 aa  601  1e-170  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 
640 aa  598  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 
640 aa  600  1e-170  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
643 aa  600  1e-170  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 
635 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
659 aa  601  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18621  threonyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
640 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1320  threonyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 
637 aa  598  1e-170  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.865645  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1010  threonyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 
640 aa  600  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1888  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 
635 aa  597  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0150098 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
645 aa  596  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>