More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1418 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02079  threonyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 642 aa  635    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4616  threonyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 		 643 aa  657    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213357 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 		 635 aa  644    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  69.87 
 
 		 636 aa  950    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  57.1 
 
 		 647 aa  740    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  52.43 
 
 		 639 aa  663    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  70.22 
 
 		 636 aa  959    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 		 638 aa  673    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  70.64 
 
 		 645 aa  964    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 644 aa  716    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  50.95 
 
 		 640 aa  672    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  69.28 
 
 		 646 aa  924    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 		 640 aa  669    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 646 aa  636    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 635 aa  659    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 635 aa  659    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1010  threonyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 		 640 aa  637    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 640 aa  637    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 639 aa  668    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3025  threonyl-tRNA synthetase  50.64 
 
 		 638 aa  638    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 		 639 aa  669    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  52.04 
 
 		 636 aa  680    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 639 aa  671    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 		 643 aa  664    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 635 aa  659    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 		 637 aa  639    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 637 aa  640    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 640 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 644 aa  716    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  50 
 
 		 638 aa  636    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 635 aa  660    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1478  threonyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 		 660 aa  650    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000148351  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 636 aa  685    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 638 aa  690    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 		 644 aa  649    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1888  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 635 aa  644    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150098 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 635 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 		 644 aa  729    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 		 639 aa  659    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 635 aa  734    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 638 aa  1320    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 		 635 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 635 aa  638    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 635 aa  676    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  69.45 
 
 		 645 aa  956    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  61.84 
 
 		 644 aa  822    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 642 aa  641    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 639 aa  668    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 		 643 aa  723    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1760  threonyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 		 642 aa  639    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000746645  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1448  threonyl-tRNA synthetase  52.27 
 
 		 639 aa  663    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1967  threonyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 640 aa  637    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134711  normal  0.0132251 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3487  threonyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 643 aa  637    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  56.31 
 
 		 633 aa  729    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 635 aa  657    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 635 aa  658    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 		 640 aa  640    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 635 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 640 aa  662    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 640 aa  650    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 		 669 aa  661    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 636 aa  646    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 635 aa  667    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 635 aa  646    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 635 aa  662    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 635 aa  643    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1745  threonyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 		 637 aa  647    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239329 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 640 aa  650    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 		 635 aa  655    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 635 aa  707    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 		 639 aa  669    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 639 aa  695    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 659 aa  652    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1896  threonyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 		 650 aa  635    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  59.3 
 
 		 644 aa  795    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 635 aa  658    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 635 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  53.61 
 
 		 638 aa  652    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 640 aa  684    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 635 aa  641    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 639 aa  668    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  58.51 
 
 		 644 aa  778    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 634 aa  711    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 641 aa  673    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1415  threonyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 		 660 aa  648    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000939714  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 		 635 aa  709    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 644 aa  646    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 635 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  50.32 
 
 		 640 aa  682    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 635 aa  658    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  64.82 
 
 		 644 aa  859    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  54.87 
 
 		 648 aa  732    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 635 aa  707    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 635 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  70.69 
 
 		 636 aa  955    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 635 aa  648    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  52.24 
 
 		 640 aa  672    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  50.32 
 
 		 640 aa  664    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2219  threonyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 635 aa  635    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00166056  normal  0.0562711 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 		 641 aa  645    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>