More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1089 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01688  threonyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 642 aa  647    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1923  threonyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 642 aa  647    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000181503  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1472  threonyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 642 aa  647    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000205456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 		 639 aa  666    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 		 636 aa  726    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2465  threonyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 640 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 635 aa  650    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2859  threonyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 		 639 aa  650    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.248456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  52.75 
 
 		 638 aa  702    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 635 aa  641    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 635 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 640 aa  730    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 		 637 aa  675    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 640 aa  639    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1765  threonyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 642 aa  635    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0145935  normal  0.0322125 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 635 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 		 640 aa  672    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1967  threonyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 640 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134711  normal  0.0132251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 640 aa  645    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  53.15 
 
 		 639 aa  734    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1937  threonyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 642 aa  648    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227542  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  53 
 
 		 639 aa  731    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 639 aa  736    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  67.82 
 
 		 635 aa  905    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 635 aa  650    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 637 aa  637    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 637 aa  637    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 640 aa  648    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1712  threonyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 642 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000703633  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  48.58 
 
 		 638 aa  641    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4616  threonyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 643 aa  654    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213357 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 635 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 635 aa  650    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  52.84 
 
 		 640 aa  724    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 635 aa  650    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 640 aa  642    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 635 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 		 644 aa  663    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2625  threonyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 642 aa  643    Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000821618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  68.09 
 
 		 635 aa  930    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 		 638 aa  709    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 635 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  55.01 
 
 		 645 aa  719    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  70.24 
 
 		 635 aa  947    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 641 aa  646    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  55.31 
 
 		 645 aa  729    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  54.57 
 
 		 644 aa  698    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 		 642 aa  670    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  53.15 
 
 		 639 aa  734    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1913  threonyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 642 aa  648    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.121147  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 		 640 aa  653    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 638 aa  642    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3487  threonyl-tRNA synthetase  50.74 
 
 		 643 aa  652    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  69.3 
 
 		 633 aa  933    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 		 635 aa  647    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  56.43 
 
 		 640 aa  732    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2665  threonyl-tRNA synthetase  59.59 
 
 		 584 aa  739    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220787  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1745  threonyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 637 aa  648    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239329 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 635 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2330  threonyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 642 aa  635    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0271546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 		 644 aa  692    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 669 aa  664    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 636 aa  659    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 635 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 		 635 aa  671    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 		 635 aa  661    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 635 aa  638    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  56.58 
 
 		 640 aa  732    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 		 638 aa  714    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2222  threonyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 642 aa  635    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000682535  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 636 aa  701    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1010  threonyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 640 aa  639    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 635 aa  651    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2219  threonyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 635 aa  641    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00166056  normal  0.0562711 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3225  threonyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 640 aa  641    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.529889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5204  threonyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 		 688 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144339 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 644 aa  647    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 635 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 635 aa  664    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2499  threonyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 638 aa  654    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0219257  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1800  threonyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 642 aa  648    Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000021107  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1724  threonyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 642 aa  646    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0116827  normal  0.392039 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06531  threonyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 640 aa  636    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1888  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 635 aa  639    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150098 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0844  threonyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 642 aa  640    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  52.52 
 
 		 639 aa  722    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  66.77 
 
 		 634 aa  888    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 		 641 aa  668    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3481  threonyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 640 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800828  normal  0.0249513 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 635 aa  1305    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  53.68 
 
 		 640 aa  683    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 635 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 640 aa  639    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1319  hypothetical protein  57.5 
 
 		 586 aa  692    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 635 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  53.17 
 
 		 644 aa  686    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 648 aa  664    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1820  threonyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 642 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000360561  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  54.43 
 
 		 636 aa  719    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2148  threonyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 642 aa  635    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00500642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>