More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2243 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01688  threonyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
642 aa  659    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1923  threonyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
642 aa  659    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000181503  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  51.66 
 
 
635 aa  677    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  55.66 
 
 
636 aa  743    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2465  threonyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 
640 aa  678    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0717195  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0641  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 
658 aa  647    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  54.78 
 
 
639 aa  687    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  58.68 
 
 
638 aa  766    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0978  threonyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 
633 aa  646    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1577  threonyl-tRNA synthetase  56.26 
 
 
635 aa  706    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704052  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 
640 aa  647    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  52.14 
 
 
640 aa  691    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2909  threonyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 
636 aa  655    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1071  threonyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
658 aa  639    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2299  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
642 aa  657    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 
640 aa  699    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 
639 aa  644    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 
635 aa  744    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 
639 aa  643    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1888  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  55.72 
 
 
635 aa  695    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0150098 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 
640 aa  639    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18621  threonyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 
640 aa  689    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 
635 aa  744    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 
637 aa  733    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  55.47 
 
 
637 aa  733    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 
640 aa  696    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2098  threonyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 
644 aa  661    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000824061  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  55.71 
 
 
638 aa  718    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0033  threonyl-tRNA synthetase  49.44 
 
 
641 aa  668    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.611945  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  56.26 
 
 
635 aa  728    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1007  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  55.64 
 
 
637 aa  689    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.245371  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2035  threonyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 
686 aa  640    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 
614 aa  706    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 
635 aa  744    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  69.07 
 
 
644 aa  929    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1931  threonyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 
640 aa  675    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0165537  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1724  threonyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 
642 aa  657    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0116827  normal  0.392039 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 
638 aa  716    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  56.89 
 
 
635 aa  736    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2018  threonyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 
642 aa  647    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000164437  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0935  threonyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 
611 aa  675    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0867221  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 
635 aa  744    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1034  threonyl-tRNA synthetase  54.25 
 
 
611 aa  667    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  54.41 
 
 
645 aa  728    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  53.39 
 
 
644 aa  687    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
642 aa  682    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 
639 aa  644    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 
635 aa  711    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2196  threonyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 
640 aa  669    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.163846  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 
638 aa  684    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3487  threonyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 
643 aa  697    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  53.8 
 
 
633 aa  687    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  57.32 
 
 
635 aa  741    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2168  threonyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 
661 aa  635    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.762302  normal  0.0294607 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06531  threonyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 
640 aa  665    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_46103  predicted protein  56.99 
 
 
564 aa  661    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.036188 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  55.31 
 
 
640 aa  736    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2859  threonyl-tRNA synthetase  50.32 
 
 
639 aa  641    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.248456  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  54.78 
 
 
669 aa  708    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  54.83 
 
 
636 aa  730    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2032  threonyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 
642 aa  657    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0621532  hitchhiker  0.0000404638 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  55.93 
 
 
635 aa  734    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 
635 aa  695    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 
635 aa  730    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1705  threonyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 
642 aa  652    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0371819  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3261  threonyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 
687 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.565813  normal  0.0408031 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1799  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  52.46 
 
 
632 aa  696    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302616  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0942  threonyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 
642 aa  659    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484442  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2417  threonyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 
644 aa  662    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00010604  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  56.85 
 
 
635 aa  729    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3089  threonyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 
639 aa  641    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.345995  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
659 aa  672    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 
635 aa  744    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  56.74 
 
 
635 aa  737    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  54.2 
 
 
640 aa  705    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 
635 aa  744    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2499  threonyl-tRNA synthetase  53.92 
 
 
638 aa  686    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0219257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5204  threonyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 
688 aa  654    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.144339 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 
635 aa  744    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0844  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
642 aa  663    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1955  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
642 aa  656    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000861339  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2021  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
642 aa  656    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0151437  normal  0.0679206 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  56.66 
 
 
641 aa  733    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2028  threonyl-tRNA synthetase  50.32 
 
 
642 aa  661    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.455146  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 
635 aa  667    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  53.43 
 
 
644 aa  675    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  56.26 
 
 
635 aa  727    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 
640 aa  686    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  56.74 
 
 
635 aa  737    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 
644 aa  664    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  66.61 
 
 
648 aa  872    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2043  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
642 aa  656    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000275607  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 
636 aa  715    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  53.53 
 
 
635 aa  696    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2148  threonyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 
642 aa  647    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00500642  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1765  threonyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 
642 aa  655    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0145935  normal  0.0322125 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 
645 aa  732    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2219  threonyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
635 aa  649    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00166056  normal  0.0562711 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  54.09 
 
 
644 aa  695    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  55.7 
 
 
641 aa  721    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>