More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1025 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 		 649 aa  650    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  51.44 
 
 		 635 aa  649    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  54.72 
 
 		 636 aa  693    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  53.53 
 
 		 643 aa  644    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  55.92 
 
 		 645 aa  692    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  54.65 
 
 		 634 aa  663    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 		 635 aa  682    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  55.23 
 
 		 646 aa  667    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 635 aa  672    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  53.68 
 
 		 635 aa  662    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  53.87 
 
 		 636 aa  682    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 640 aa  653    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  53.61 
 
 		 638 aa  665    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  51.86 
 
 		 644 aa  646    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 		 636 aa  684    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  54.89 
 
 		 645 aa  685    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 644 aa  673    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  53.65 
 
 		 633 aa  669    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 		 639 aa  649    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 638 aa  1300    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 638 aa  653    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 644 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 634 aa  661    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 640 aa  653    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 643 aa  649    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  54.46 
 
 		 635 aa  665    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 644 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  53.58 
 
 		 644 aa  665    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 		 648 aa  639    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  54.72 
 
 		 636 aa  680    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 644 aa  659    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  55.32 
 
 		 637 aa  669    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 647 aa  633  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 644 aa  631  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 		 638 aa  626  1e-178  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  51.45 
 
 		 636 aa  625  1e-178  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 644 aa  624  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 638 aa  620  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 639 aa  620  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 643 aa  619  1e-176  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 639 aa  620  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 		 640 aa  619  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 		 640 aa  618  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0753  threonyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 582 aa  618  1e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.105849  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 		 639 aa  617  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 		 640 aa  615  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 		 614 aa  615  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 		 639 aa  617  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  51.77 
 
 		 659 aa  616  1e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  52.64 
 
 		 582 aa  615  1e-175  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 		 640 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 		 639 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 639 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 639 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  50.49 
 
 		 636 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 		 631 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 		 582 aa  611  1e-173  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000323411  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 638 aa  608  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2665  threonyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 		 584 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220787  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 635 aa  607  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 634 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 637 aa  603  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 637 aa  604  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1007  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 637 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.245371  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 		 637 aa  602  1.0000000000000001e-171  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 635 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 635 aa  605  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 641 aa  605  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 635 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 635 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 635 aa  601  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 635 aa  601  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 635 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 635 aa  601  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 635 aa  598  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 636 aa  599  1e-170  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 635 aa  598  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 635 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 635 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 		 647 aa  598  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0033  threonyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 641 aa  596  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.611945  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 635 aa  598  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 635 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 646 aa  597  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0006  threonyl-tRNA synthetase  51.64 
 
 		 633 aa  596  1e-169  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.999215  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 635 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 635 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1577  threonyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 635 aa  594  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 635 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 		 635 aa  593  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 635 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06531  threonyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 638 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.218915  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 635 aa  594  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 662 aa  592  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 635 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 635 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1745  threonyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 637 aa  590  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239329 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 635 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0597  threonyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 		 638 aa  591  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.56327  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 669 aa  589  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>