More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0725 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 		 646 aa  662    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 640 aa  688    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  55.49 
 
 		 635 aa  751    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 		 636 aa  676    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 639 aa  692    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 644 aa  655    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 		 640 aa  692    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 636 aa  672    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 640 aa  666    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 		 640 aa  692    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 		 638 aa  652    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 		 639 aa  690    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 		 639 aa  684    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 639 aa  690    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 		 639 aa  692    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 635 aa  635    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  66.61 
 
 		 640 aa  910    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 639 aa  690    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 634 aa  644    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 638 aa  1321    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 		 631 aa  666    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 644 aa  655    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  63.15 
 
 		 640 aa  824    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 635 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  53.06 
 
 		 635 aa  701    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 637 aa  658    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 638 aa  690    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 635 aa  635    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 645 aa  683    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 644 aa  642    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 637 aa  674    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 		 639 aa  690    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 662 aa  640    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 633 aa  724    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  67.09 
 
 		 640 aa  915    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 634 aa  699    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 635 aa  635    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 635 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 635 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 636 aa  681    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 		 639 aa  697    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 		 635 aa  643    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 635 aa  636    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  72.76 
 
 		 636 aa  1000    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  53.06 
 
 		 635 aa  716    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 		 645 aa  664    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 643 aa  665    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2665  threonyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 		 584 aa  638    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 635 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0627  threonyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 		 588 aa  647    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 		 635 aa  711    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 		 636 aa  671    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  57.3 
 
 		 634 aa  734    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 		 635 aa  714    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 		 640 aa  687    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 644 aa  662    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 		 636 aa  673    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 644 aa  632  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 635 aa  632  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 635 aa  632  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 		 649 aa  632  1e-180  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 648 aa  634  1e-180  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 635 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 635 aa  629  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 647 aa  629  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 635 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 640 aa  630  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 635 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 644 aa  629  1e-179  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 635 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 641 aa  628  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 635 aa  628  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 635 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1319  hypothetical protein  52.63 
 
 		 586 aa  626  1e-178  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04450  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  52.02 
 
 		 586 aa  624  1e-177  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0386598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 633 aa  622  1e-177  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 643 aa  622  1e-177  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 635 aa  624  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 644 aa  622  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 652 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 635 aa  624  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 643 aa  618  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 638 aa  618  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 		 638 aa  616  1e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 635 aa  617  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 635 aa  618  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 646 aa  617  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 641 aa  615  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 640 aa  614  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 		 639 aa  613  9.999999999999999e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1010  threonyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 		 640 aa  612  9.999999999999999e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16370  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  51.67 
 
 		 586 aa  611  1e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.12349 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 669 aa  609  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 659 aa  608  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0844  threonyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 642 aa  609  1e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003716  threonyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 		 642 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000263633  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 		 635 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 635 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02079  threonyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 642 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2219  threonyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 635 aa  608  9.999999999999999e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00166056  normal  0.0562711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>