More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2639 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  63.1 
 
 		 646 aa  834    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 640 aa  637    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  53.39 
 
 		 644 aa  687    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_002936  DET0753  threonyl-tRNA synthetase  54.74 
 
 		 582 aa  635    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.105849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  64.09 
 
 		 636 aa  847    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 		 640 aa  643    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  53.39 
 
 		 644 aa  687    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 638 aa  662    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2368  threonyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 644 aa  635    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.642893  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 640 aa  641    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  51.08 
 
 		 635 aa  647    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  51.55 
 
 		 637 aa  651    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 		 634 aa  672    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  50.32 
 
 		 633 aa  656    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 		 639 aa  636    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 639 aa  637    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 639 aa  638    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 639 aa  636    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 637 aa  644    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 637 aa  643    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 635 aa  635    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  77.02 
 
 		 644 aa  1060    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  55.45 
 
 		 635 aa  724    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 		 631 aa  707    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  63.74 
 
 		 636 aa  835    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  52.07 
 
 		 644 aa  671    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2665  threonyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 584 aa  639    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220787  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  61.84 
 
 		 638 aa  822    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  64.18 
 
 		 645 aa  858    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  64.56 
 
 		 645 aa  859    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 644 aa  1331    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 639 aa  714    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 639 aa  637    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 638 aa  658    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 		 635 aa  717    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 		 633 aa  731    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  67.39 
 
 		 647 aa  936    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  76.09 
 
 		 644 aa  1035    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  53.18 
 
 		 638 aa  696    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 638 aa  642    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 		 635 aa  637    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  63.26 
 
 		 636 aa  832    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 669 aa  635    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 636 aa  638    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  56.85 
 
 		 635 aa  752    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 643 aa  687    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 640 aa  635    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 		 640 aa  671    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 636 aa  676    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 		 643 aa  635    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  69.94 
 
 		 644 aa  962    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 643 aa  691    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 635 aa  705    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  56.53 
 
 		 637 aa  732    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 640 aa  676    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  49.35 
 
 		 641 aa  648    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  54.57 
 
 		 635 aa  698    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  56.31 
 
 		 634 aa  748    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  66.3 
 
 		 649 aa  929    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  62.38 
 
 		 644 aa  826    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  55.87 
 
 		 648 aa  714    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 582 aa  636    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000323411  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  62.56 
 
 		 636 aa  820    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 641 aa  650    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  56.43 
 
 		 634 aa  736    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 		 639 aa  633  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4616  threonyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 643 aa  634  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213357 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 		 640 aa  634  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 635 aa  633  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  50.58 
 
 		 635 aa  631  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 636 aa  634  1e-180  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 		 583 aa  634  1e-180  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 640 aa  632  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 		 639 aa  633  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1448  threonyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 639 aa  630  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1745  threonyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 637 aa  630  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239329 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1007  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 		 637 aa  631  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.245371  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 		 614 aa  630  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0081  threonyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 605 aa  629  1e-179  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000716431  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  54.56 
 
 		 582 aa  631  1e-179  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 		 639 aa  629  1e-179  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 640 aa  631  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  48.69 
 
 		 640 aa  626  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 635 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 635 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 635 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 635 aa  625  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 635 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 635 aa  625  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 635 aa  627  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 659 aa  628  1e-178  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 635 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 635 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 		 640 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 635 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2465  threonyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 640 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 640 aa  623  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3025  threonyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 		 638 aa  624  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3487  threonyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 643 aa  622  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 635 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>