More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1384 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  55.68 
 
 		 646 aa  709    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  53.76 
 
 		 638 aa  656    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 		 640 aa  720    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1760  threonyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 642 aa  639    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000746645  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 		 636 aa  718    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  51.89 
 
 		 640 aa  717    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 635 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  66.98 
 
 		 635 aa  901    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 638 aa  691    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 		 644 aa  676    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 		 647 aa  654    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 		 640 aa  714    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 635 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 635 aa  1298    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3089  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 639 aa  636    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.345995  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1319  hypothetical protein  56.44 
 
 		 586 aa  669    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 639 aa  637    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2665  threonyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 		 584 aa  706    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 640 aa  719    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 639 aa  723    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 		 644 aa  676    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  51.89 
 
 		 639 aa  720    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1010  threonyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 		 640 aa  637    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  51.89 
 
 		 639 aa  721    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 635 aa  649    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 635 aa  645    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 		 637 aa  660    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 637 aa  659    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1373  threonyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 645 aa  644    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000340223  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 640 aa  635    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  49.13 
 
 		 638 aa  638    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1448  threonyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 		 639 aa  636    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 635 aa  639    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 635 aa  645    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1007  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 		 637 aa  640    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.245371  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1888  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 635 aa  646    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150098 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  53.53 
 
 		 636 aa  718    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 635 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 		 644 aa  709    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4616  threonyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 		 643 aa  648    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213357 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  65.93 
 
 		 634 aa  889    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 638 aa  707    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 635 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 640 aa  722    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 635 aa  645    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  60.76 
 
 		 636 aa  810    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 635 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  55.77 
 
 		 645 aa  728    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  55.45 
 
 		 644 aa  724    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 642 aa  645    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 639 aa  723    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 635 aa  661    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 635 aa  646    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 		 638 aa  654    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 		 635 aa  648    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  67.46 
 
 		 633 aa  901    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 635 aa  644    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 		 637 aa  675    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 		 645 aa  712    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 		 641 aa  649    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 		 638 aa  711    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  68.14 
 
 		 635 aa  931    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 669 aa  656    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 		 636 aa  657    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 635 aa  645    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 635 aa  657    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 635 aa  649    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 635 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  62.11 
 
 		 639 aa  847    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  50.32 
 
 		 640 aa  702    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10531  threonyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 		 638 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.487806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 640 aa  682    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 		 636 aa  716    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 635 aa  646    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 644 aa  688    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 		 636 aa  713    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 		 640 aa  663    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 635 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 		 640 aa  653    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  51.5 
 
 		 635 aa  663    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 635 aa  651    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06531  threonyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 		 640 aa  645    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 635 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 640 aa  637    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  55.03 
 
 		 643 aa  714    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 		 639 aa  713    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 		 641 aa  649    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  51.89 
 
 		 639 aa  720    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  67.82 
 
 		 635 aa  905    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  50.57 
 
 		 644 aa  635    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 635 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 640 aa  636    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18621  threonyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 640 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 635 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  54.92 
 
 		 644 aa  692    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 648 aa  676    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  63.62 
 
 		 635 aa  864    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  55.08 
 
 		 636 aa  718    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  51.89 
 
 		 639 aa  721    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 		 644 aa  709    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>