More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4204 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 662 aa  682    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1732  threonyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 630 aa  655    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2483  threonyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 637 aa  669    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0764303  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4204  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 736 aa  1516    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 647 aa  642    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 641 aa  635    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 646 aa  627  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 645 aa  624  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 657 aa  622  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 644 aa  615  1e-175  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 648 aa  606  9.999999999999999e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 647 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 677 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 652 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 648 aa  598  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 604 aa  596  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 657 aa  596  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0024  threonyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 648 aa  593  1e-168  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0992  threonyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 647 aa  589  1e-167  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 657 aa  589  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 657 aa  588  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 653 aa  582  1.0000000000000001e-165  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 659 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 659 aa  585  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 646 aa  580  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 638 aa  582  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 675 aa  579  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 649 aa  577  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 608 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 636 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 635 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 644 aa  569  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 644 aa  569  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 648 aa  570  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 635 aa  572  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 646 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 644 aa  561  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2606  threonyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 604 aa  557  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0580419 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 643 aa  558  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 639 aa  554  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 639 aa  554  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 635 aa  555  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 639 aa  552  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 639 aa  550  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 645 aa  549  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 640 aa  550  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 639 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 645 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 645 aa  546  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 		 647 aa  548  1e-154  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 645 aa  546  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 645 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 645 aa  546  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 639 aa  547  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 645 aa  546  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 645 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 645 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 645 aa  546  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 638 aa  545  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1577  threonyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 635 aa  542  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 640 aa  542  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 645 aa  543  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 647 aa  545  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 639 aa  542  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 640 aa  544  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 648 aa  545  1e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 642 aa  539  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 633 aa  540  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 637 aa  541  9.999999999999999e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1457  threonyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 608 aa  541  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 641 aa  541  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 644 aa  540  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 635 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 644 aa  538  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 640 aa  535  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 635 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 635 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 635 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3487  threonyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 643 aa  530  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 		 640 aa  530  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 635 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2196  threonyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 640 aa  526  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.163846  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1007  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 637 aa  523  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.245371  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 614 aa  523  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 637 aa  523  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 645 aa  520  1e-146  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 635 aa  522  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 635 aa  522  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 635 aa  522  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 635 aa  522  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 635 aa  522  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 		 643 aa  522  1e-146  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 636 aa  520  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 583 aa  520  1e-146  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 635 aa  522  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 635 aa  522  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1448  threonyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 639 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2168  threonyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 661 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.762302  normal  0.0294607 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 640 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2276  threonyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 675 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.644859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>