More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2606 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_2841  threonyl-tRNA synthetase  77.18 
 
 		 606 aa  964    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  79.93 
 
 		 608 aa  1013    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  54.65 
 
 		 604 aa  677    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  53.39 
 
 		 614 aa  661    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2787  threonyl-tRNA synthetase  79.02 
 
 		 615 aa  976    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0935  threonyl-tRNA synthetase  61.4 
 
 		 611 aa  742    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0867221  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1034  threonyl-tRNA synthetase  60.51 
 
 		 611 aa  734    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2606  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 604 aa  1240    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0580419 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33493  predicted protein  53.64 
 
 		 684 aa  672    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0731  threonyl-tRNA synthetase  78.74 
 
 		 607 aa  998    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_46103  predicted protein  56.49 
 
 		 564 aa  643    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.036188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0387  threonyl-tRNA synthetase  78.49 
 
 		 610 aa  989    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.677095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1457  threonyl-tRNA synthetase  77.89 
 
 		 608 aa  985    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0760  threonyl-tRNA synthetase  78.74 
 
 		 607 aa  998    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.281808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 677 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 657 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 657 aa  606  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 657 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 662 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 		 659 aa  598  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 649 aa  597  1e-169  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 645 aa  595  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 		 596 aa  593  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 657 aa  593  1e-168  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  51.39 
 
 		 641 aa  589  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2483  threonyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 		 637 aa  590  1e-167  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0764303  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 647 aa  591  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1732  threonyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 		 630 aa  588  1e-166  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 		 675 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 646 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 643 aa  568  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 653 aa  566  1e-160  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 648 aa  560  1e-158  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2511  threonyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 594 aa  555  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0678043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4204  threonyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 736 aa  557  1e-157  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 638 aa  558  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 649 aa  554  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 644 aa  553  1e-156  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  49.12 
 
 		 647 aa  554  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 		 635 aa  555  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0110  threonyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 595 aa  551  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 648 aa  550  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0349  threonyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 595 aa  546  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 644 aa  545  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 644 aa  545  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 583 aa  546  1e-154  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 644 aa  548  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 644 aa  545  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 636 aa  548  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 636 aa  542  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 645 aa  541  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 645 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 645 aa  543  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 645 aa  543  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 636 aa  543  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 645 aa  541  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 652 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 645 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 645 aa  541  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 645 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 635 aa  544  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2043  threonyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 669 aa  544  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000086336 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2317  threonyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 669 aa  542  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 646 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0992  threonyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 647 aa  541  9.999999999999999e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 645 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 633 aa  539  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 645 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 644 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 645 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 659 aa  540  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 647 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 643 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 634 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 638 aa  536  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 645 aa  538  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2095  threonyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 684 aa  535  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00031634  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 635 aa  533  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 646 aa  531  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 643 aa  535  1e-150  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 635 aa  534  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 641 aa  532  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 635 aa  533  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 643 aa  532  1e-150  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 		 644 aa  530  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 644 aa  529  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 639 aa  531  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 648 aa  529  1e-149  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1919  threonyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 677 aa  529  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.615568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 636 aa  530  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 645 aa  527  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 647 aa  525  1e-148  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 639 aa  527  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 631 aa  525  1e-148  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 645 aa  527  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0024  threonyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 648 aa  527  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 		 637 aa  528  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3269  threonyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 657 aa  526  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2368  threonyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 644 aa  524  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.642893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 638 aa  524  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>