More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0121 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  54.96 
 
 
645 aa  674    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 
645 aa  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 
647 aa  671    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0349  threonyl-tRNA synthetase  55.96 
 
 
595 aa  639    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129605  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 
645 aa  651    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 
645 aa  651    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 
645 aa  651    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  54.87 
 
 
648 aa  670    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 
645 aa  652    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  55.8 
 
 
604 aa  689    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 
645 aa  676    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 
645 aa  651    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 
645 aa  676    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  58.57 
 
 
662 aa  661    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  55.91 
 
 
645 aa  649    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0110  threonyl-tRNA synthetase  55.59 
 
 
595 aa  647    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
596 aa  1228    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 
645 aa  652    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 
645 aa  651    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 
644 aa  675    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  55.92 
 
 
652 aa  669    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 
643 aa  656    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  55.94 
 
 
648 aa  673    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 
645 aa  652    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1192  threonyl-tRNA synthetase  55.4 
 
 
652 aa  641    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0753  threonyl-tRNA synthetase  54.2 
 
 
582 aa  631  1e-180  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.105849  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0982  threonyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 
652 aa  634  1e-180  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0768948  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  54.55 
 
 
582 aa  634  1e-180  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 
582 aa  629  1e-179  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000323411  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  52.27 
 
 
645 aa  630  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2511  threonyl-tRNA synthetase  53.53 
 
 
594 aa  626  1e-178  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0678043  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  53.18 
 
 
647 aa  622  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 
639 aa  624  1e-177  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 
646 aa  617  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 
643 aa  616  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 
608 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 
659 aa  608  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0662  threonyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 
652 aa  611  1e-173  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 
641 aa  608  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1732  threonyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 
630 aa  602  1.0000000000000001e-171  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 
647 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 
643 aa  600  1e-170  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2181  threonyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 
646 aa  600  1e-170  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 
635 aa  598  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  51.86 
 
 
649 aa  597  1e-169  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2606  threonyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 
604 aa  593  1e-168  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0580419 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0387  threonyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
610 aa  594  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.677095  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 
638 aa  588  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2787  threonyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
615 aa  588  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100504  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 
648 aa  589  1e-167  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1457  threonyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
608 aa  590  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 
677 aa  586  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0760  threonyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 
607 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.281808  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 
647 aa  586  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  50.89 
 
 
644 aa  585  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0731  threonyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 
607 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  50.89 
 
 
644 aa  585  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
636 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  52.21 
 
 
653 aa  582  1.0000000000000001e-165  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1373  threonyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 
645 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000340223  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2841  threonyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
606 aa  582  1.0000000000000001e-165  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
657 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 
648 aa  583  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2230  threonyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
666 aa  580  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883238  hitchhiker  0.00000834751 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 
657 aa  581  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 
657 aa  580  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2483  threonyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 
637 aa  580  1e-164  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0764303  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0992  threonyl-tRNA synthetase  50.97 
 
 
647 aa  578  1e-164  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 
644 aa  579  1e-164  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
645 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 
659 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  50.44 
 
 
635 aa  575  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 
646 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 
675 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 
645 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
657 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
644 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0460  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  48.1 
 
 
663 aa  573  1.0000000000000001e-162  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0696284  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
636 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 
635 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0024  threonyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 
648 aa  568  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 
635 aa  571  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 
644 aa  570  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 
636 aa  571  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 
635 aa  570  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 
636 aa  568  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
639 aa  567  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2108  threonyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 
659 aa  568  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3269  threonyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 
657 aa  565  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 
635 aa  567  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 
640 aa  566  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2078  threonyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 
657 aa  565  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 
644 aa  567  1e-160  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
635 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
635 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
635 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
635 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 
583 aa  565  1.0000000000000001e-159  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
635 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1415  threonyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 
643 aa  563  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000260393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>