More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2483 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1732  threonyl-tRNA synthetase  58.78 
 
 		 630 aa  778    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4204  threonyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 736 aa  669    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 662 aa  638    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2483  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 637 aa  1321    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0764303  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 		 604 aa  607  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 657 aa  607  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 659 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 649 aa  602  1.0000000000000001e-171  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 677 aa  600  1e-170  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  49.12 
 
 		 646 aa  599  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 675 aa  599  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 		 657 aa  595  1e-169  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 657 aa  595  1e-169  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 645 aa  597  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 		 657 aa  596  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 608 aa  592  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 		 641 aa  593  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2606  threonyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 		 604 aa  590  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0580419 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 647 aa  590  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 644 aa  585  1e-166  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0387  threonyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 610 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.677095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0760  threonyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 607 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.281808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0731  threonyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 607 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2787  threonyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 615 aa  578  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 596 aa  580  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 648 aa  574  1.0000000000000001e-162  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 		 643 aa  565  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 647 aa  566  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1457  threonyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 		 608 aa  567  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2841  threonyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 606 aa  568  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 644 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 583 aa  561  1e-158  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 652 aa  555  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 638 aa  552  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 653 aa  550  1e-155  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 639 aa  550  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0992  threonyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 		 647 aa  549  1e-155  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 648 aa  551  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0024  threonyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 648 aa  547  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  44.43 
 
 		 582 aa  544  1e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 659 aa  544  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 643 aa  542  1e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 645 aa  539  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 635 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 		 634 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 645 aa  539  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 		 614 aa  541  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 		 644 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 635 aa  538  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 635 aa  537  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 637 aa  537  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2511  threonyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 594 aa  537  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0678043  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0753  threonyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 582 aa  535  1e-150  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.105849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 639 aa  533  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0935  threonyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 611 aa  531  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0867221  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 634 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 645 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 645 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 645 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 645 aa  526  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 645 aa  526  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 645 aa  525  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1034  threonyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 611 aa  526  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 645 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 648 aa  528  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 645 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 645 aa  526  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 635 aa  524  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 637 aa  524  1e-147  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 633 aa  522  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 645 aa  522  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 643 aa  524  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 644 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 635 aa  522  1e-147  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 635 aa  524  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 645 aa  521  1e-146  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2665  threonyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 584 aa  519  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220787  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  43.68 
 
 		 638 aa  520  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 644 aa  521  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 635 aa  521  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 640 aa  520  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 648 aa  519  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 631 aa  520  1e-146  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 636 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 640 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 647 aa  518  1.0000000000000001e-145  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 636 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 638 aa  516  1.0000000000000001e-145  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 635 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2631  threonyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 643 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2317  threonyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 643 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 640 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 635 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 635 aa  512  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 645 aa  513  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1373  threonyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 		 645 aa  514  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000340223  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 635 aa  512  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 635 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4760  threonyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 628 aa  513  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0619486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 647 aa  509  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>