More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0935 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_33493  predicted protein  59.47 
 
 		 684 aa  782    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 644 aa  675    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 644 aa  675    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0387  threonyl-tRNA synthetase  59.11 
 
 		 610 aa  727    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.677095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 643 aa  667    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  62.84 
 
 		 614 aa  802    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2787  threonyl-tRNA synthetase  56.72 
 
 		 615 aa  696    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  57.32 
 
 		 644 aa  672    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 		 608 aa  718    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0935  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 611 aa  1262    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0867221  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0760  threonyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 		 607 aa  692    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.281808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1034  threonyl-tRNA synthetase  87.87 
 
 		 611 aa  1100    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 		 638 aa  652    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2606  threonyl-tRNA synthetase  61.4 
 
 		 604 aa  742    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0580419 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_46103  predicted protein  65.06 
 
 		 564 aa  767    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.036188 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0731  threonyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 		 607 aa  692    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1457  threonyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 608 aa  692    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2841  threonyl-tRNA synthetase  56.83 
 
 		 606 aa  692    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  55.12 
 
 		 648 aa  662    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 		 649 aa  598  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 		 635 aa  588  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 		 643 aa  588  1e-167  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 645 aa  587  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 646 aa  586  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 634 aa  585  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0744  threonyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 581 aa  587  1e-166  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 		 636 aa  585  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 644 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 636 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 635 aa  578  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 583 aa  580  1e-164  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 644 aa  581  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 636 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 636 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  51 
 
 		 638 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  50.74 
 
 		 582 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 635 aa  570  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  50.37 
 
 		 582 aa  569  1e-161  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000323411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 645 aa  570  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_002936  DET0753  threonyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 		 582 aa  567  1e-160  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.105849  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 631 aa  567  1e-160  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 647 aa  567  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2043  threonyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 669 aa  565  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000086336 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 644 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 644 aa  562  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 635 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 633 aa  560  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 637 aa  560  1e-158  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 635 aa  559  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 		 638 aa  555  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 637 aa  555  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2317  threonyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 669 aa  555  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104069  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3269  threonyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 657 aa  553  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12633  threonyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 		 692 aa  552  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10670  threonyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 		 672 aa  553  1e-156  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000327769  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 634 aa  553  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 		 659 aa  553  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 639 aa  553  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 644 aa  552  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1783  threonyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 670 aa  550  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.0885436 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3188  threonyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 690 aa  546  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2281  threonyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 684 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2242  threonyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 684 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17410  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  47.72 
 
 		 676 aa  547  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.595758  normal  0.0835389 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2095  threonyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 684 aa  546  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00031634  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2230  threonyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 666 aa  546  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883238  hitchhiker  0.00000834751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2289  threonyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 684 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0841  threonine--tRNA ligase  46.58 
 
 		 676 aa  545  1e-153  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 637 aa  543  1e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 634 aa  544  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1764  threonyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 		 658 aa  543  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279145  hitchhiker  0.00103927 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 643 aa  541  9.999999999999999e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 604 aa  540  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13900  threonyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 666 aa  540  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0274631  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 638 aa  538  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3147  threonyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 701 aa  536  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 649 aa  535  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1378  threonyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 673 aa  535  1e-151  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0410171  normal  0.0241813 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2078  threonyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 657 aa  538  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2558  threonyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 		 691 aa  535  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 637 aa  533  1e-150  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1919  threonyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 677 aa  533  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.615568  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3838  threonyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 695 aa  535  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.400381  normal  0.082381 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 636 aa  533  1e-150  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1979  threonyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 		 671 aa  533  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000566637 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 		 640 aa  529  1e-149  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 		 640 aa  530  1e-149  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2108  threonyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 659 aa  531  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2483  threonyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 637 aa  531  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0764303  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2089  threonyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 682 aa  531  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 641 aa  530  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0448  threonyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 677 aa  529  1e-149  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.145335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 		 641 aa  531  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0199  threonyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 602 aa  525  1e-148  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14910  threonyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 692 aa  526  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0028  threonyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 603 aa  526  1e-148  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5204  threonyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 688 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144339 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 636 aa  526  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4525  threonyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 659 aa  527  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.082511 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0081  threonyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 605 aa  527  1e-148  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000716431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>