More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0028 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0081  threonyl-tRNA synthetase  74.88 
 
 		 605 aa  948    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000716431  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 636 aa  652    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0611  threonyl-tRNA synthetase  77.1 
 
 		 609 aa  987    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.260291  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1819  threonyl-tRNA synthetase  78.48 
 
 		 606 aa  993    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.196151  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0199  threonyl-tRNA synthetase  87.4 
 
 		 602 aa  1095    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0028  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 603 aa  1243    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 645 aa  656    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 636 aa  667    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 649 aa  638    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 645 aa  660    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0066  threonyl-tRNA synthetase  65.79 
 
 		 602 aa  860    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000216362  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0216  threonyl-tRNA synthetase  86.73 
 
 		 602 aa  1086    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  54 
 
 		 636 aa  670    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0330  threonyl-tRNA synthetase  78.31 
 
 		 606 aa  991    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000295964  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  53.49 
 
 		 646 aa  647    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0238  threonyl-tRNA synthetase  87.06 
 
 		 602 aa  1094    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 		 644 aa  635    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1702  threonyl-tRNA synthetase  76.86 
 
 		 617 aa  986    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000310236  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  51.66 
 
 		 636 aa  652    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 644 aa  623  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 644 aa  619  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 644 aa  617  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 647 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 		 638 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 637 aa  610  1e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 644 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 635 aa  597  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 640 aa  595  1e-169  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 		 643 aa  593  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 640 aa  594  1e-168  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 644 aa  591  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 638 aa  589  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 		 643 aa  590  1e-167  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  49.12 
 
 		 634 aa  587  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 643 aa  586  1e-166  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 635 aa  584  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 633 aa  582  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 637 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 637 aa  580  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 639 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 639 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 639 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 640 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 639 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 644 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 644 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 635 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 639 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 640 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 		 639 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 633 aa  574  1.0000000000000001e-162  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 640 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 635 aa  571  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 640 aa  571  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 634 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 639 aa  566  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 637 aa  565  1e-160  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 637 aa  566  1e-160  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 639 aa  568  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 636 aa  566  1e-160  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0627  threonyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 		 588 aa  563  1.0000000000000001e-159  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16370  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  49.74 
 
 		 586 aa  562  1.0000000000000001e-159  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.12349 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 640 aa  561  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 631 aa  561  1e-158  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 646 aa  561  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  49.3 
 
 		 582 aa  556  1e-157  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 		 640 aa  556  1e-157  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 638 aa  557  1e-157  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 635 aa  554  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 637 aa  552  1e-156  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  46.66 
 
 		 636 aa  554  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04450  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  48.52 
 
 		 586 aa  554  1e-156  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0386598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 640 aa  550  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 638 aa  550  1e-155  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 640 aa  549  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 582 aa  550  1e-155  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000323411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 640 aa  549  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 640 aa  551  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 634 aa  549  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0753  threonyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 		 582 aa  546  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.105849  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33493  predicted protein  46.05 
 
 		 684 aa  547  1e-154  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 640 aa  546  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 614 aa  546  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 642 aa  547  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 662 aa  541  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2465  threonyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 640 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 640 aa  545  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1967  threonyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 640 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134711  normal  0.0132251 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3225  threonyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 640 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.529889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3481  threonyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 640 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800828  normal  0.0249513 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  45.33 
 
 		 638 aa  539  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1870  threonyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 635 aa  540  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47552  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 638 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 669 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 645 aa  539  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3623  threonyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 643 aa  536  1e-151  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3025  threonyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 638 aa  536  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 641 aa  536  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 		 648 aa  538  1e-151  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 635 aa  536  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>