More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1378 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2089  threonyl-tRNA synthetase  64.3 
 
 		 682 aa  891    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15440  threonyl-tRNA synthetase  65.47 
 
 		 660 aa  903    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.374739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12633  threonyl-tRNA synthetase  65.22 
 
 		 692 aa  859    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3188  threonyl-tRNA synthetase  66.46 
 
 		 690 aa  897    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1979  threonyl-tRNA synthetase  71.34 
 
 		 671 aa  989    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000566637 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14910  threonyl-tRNA synthetase  65.68 
 
 		 692 aa  866    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2281  threonyl-tRNA synthetase  65.83 
 
 		 684 aa  870    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3269  threonyl-tRNA synthetase  66.82 
 
 		 657 aa  926    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2392  threonyl-tRNA synthetase  62.27 
 
 		 668 aa  837    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451072  hitchhiker  0.00797277 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2108  threonyl-tRNA synthetase  66.02 
 
 		 659 aa  871    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2287  threonyl-tRNA synthetase  62.84 
 
 		 691 aa  848    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12385  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1378  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 673 aa  1391    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0410171  normal  0.0241813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3838  threonyl-tRNA synthetase  64.5 
 
 		 695 aa  868    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.400381  normal  0.082381 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3066  threonyl-tRNA synthetase  65.07 
 
 		 656 aa  897    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.408536  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3147  threonyl-tRNA synthetase  64.12 
 
 		 701 aa  877    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1783  threonyl-tRNA synthetase  75 
 
 		 670 aa  1042    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.0885436 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1783  threonyl-tRNA synthetase  62.13 
 
 		 671 aa  805    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.491934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3442  threonyl-tRNA synthetase  64.55 
 
 		 699 aa  878    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000446012  hitchhiker  0.0000744788 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10670  threonyl-tRNA synthetase  71.73 
 
 		 672 aa  1017    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000327769  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1919  threonyl-tRNA synthetase  66.93 
 
 		 677 aa  890    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.615568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1770  threonyl-tRNA synthetase  62.3 
 
 		 671 aa  800    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0365193  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2078  threonyl-tRNA synthetase  66.22 
 
 		 657 aa  921    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1656  threonyl-tRNA synthetase  65.29 
 
 		 672 aa  890    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291225  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2095  threonyl-tRNA synthetase  59.23 
 
 		 684 aa  822    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00031634  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2242  threonyl-tRNA synthetase  65.83 
 
 		 684 aa  870    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13900  threonyl-tRNA synthetase  72.55 
 
 		 666 aa  1019    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0274631  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17410  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  79.22 
 
 		 676 aa  1092    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.595758  normal  0.0835389 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0448  threonyl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 677 aa  924    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.145335  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2043  threonyl-tRNA synthetase  70.65 
 
 		 669 aa  1015    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000086336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1764  threonyl-tRNA synthetase  63.53 
 
 		 658 aa  879    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279145  hitchhiker  0.00103927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2317  threonyl-tRNA synthetase  70.2 
 
 		 669 aa  1007    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104069  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0841  threonine--tRNA ligase  65.56 
 
 		 676 aa  924    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6132  threonyl-tRNA synthetase  62.57 
 
 		 659 aa  857    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158599  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1358  threonyl-tRNA synthetase  63.65 
 
 		 685 aa  872    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.462189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2230  threonyl-tRNA synthetase  65.57 
 
 		 666 aa  910    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883238  hitchhiker  0.00000834751 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2370  threonyl-tRNA synthetase  62.67 
 
 		 668 aa  860    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2289  threonyl-tRNA synthetase  65.83 
 
 		 684 aa  870    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2558  threonyl-tRNA synthetase  65.67 
 
 		 691 aa  868    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 648 aa  582  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 		 644 aa  569  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 		 644 aa  569  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 636 aa  568  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 645 aa  560  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 638 aa  559  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 643 aa  561  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 644 aa  555  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 646 aa  555  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 614 aa  553  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 643 aa  549  1e-155  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 645 aa  549  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 636 aa  546  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 583 aa  543  1e-153  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 636 aa  542  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 644 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 639 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 638 aa  539  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 636 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 659 aa  541  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 644 aa  540  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 		 604 aa  536  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0935  threonyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 611 aa  535  1e-151  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0867221  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 644 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0744  threonyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 581 aa  533  1e-150  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0359075  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1034  threonyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 611 aa  534  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 649 aa  535  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 638 aa  530  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 639 aa  530  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 637 aa  529  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 635 aa  527  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 644 aa  528  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 633 aa  528  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 644 aa  526  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 635 aa  522  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3886  threonyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 687 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1924  threonyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 675 aa  522  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0331233 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 596 aa  523  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 635 aa  522  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 637 aa  525  1e-147  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1638  threonyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 660 aa  522  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.360122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 634 aa  522  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5204  threonyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 688 aa  521  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6323  threonyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 670 aa  521  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103626 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 662 aa  521  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 648 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 608 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1229  threonyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 623 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1007  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 637 aa  512  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.245371  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2787  threonyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 615 aa  513  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2276  threonyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 675 aa  513  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.644859 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2368  threonyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 644 aa  514  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.642893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33493  predicted protein  44.24 
 
 		 684 aa  513  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1054  threonyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 660 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290687  normal  0.56724 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 635 aa  509  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 640 aa  510  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 645 aa  509  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 640 aa  511  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2321  threonyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 675 aa  509  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.313721 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 638 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 635 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 636 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>