More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_14910 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3269  threonyl-tRNA synthetase  68.07 
 
 		 657 aa  907    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6132  threonyl-tRNA synthetase  67.22 
 
 		 659 aa  887    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158599  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1783  threonyl-tRNA synthetase  67.3 
 
 		 670 aa  863    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.0885436 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0841  threonine--tRNA ligase  62.75 
 
 		 676 aa  832    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3838  threonyl-tRNA synthetase  74.37 
 
 		 695 aa  1042    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.400381  normal  0.082381 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10670  threonyl-tRNA synthetase  65.01 
 
 		 672 aa  856    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000327769  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3442  threonyl-tRNA synthetase  72.74 
 
 		 699 aa  1019    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000446012  hitchhiker  0.0000744788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2281  threonyl-tRNA synthetase  73.53 
 
 		 684 aa  1016    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2078  threonyl-tRNA synthetase  68.13 
 
 		 657 aa  924    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2089  threonyl-tRNA synthetase  78.51 
 
 		 682 aa  1130    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2230  threonyl-tRNA synthetase  70.03 
 
 		 666 aa  935    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883238  hitchhiker  0.00000834751 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14910  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 692 aa  1421    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2108  threonyl-tRNA synthetase  66.47 
 
 		 659 aa  877    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1770  threonyl-tRNA synthetase  66.2 
 
 		 671 aa  861    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0365193  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2043  threonyl-tRNA synthetase  67.5 
 
 		 669 aa  883    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000086336 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1979  threonyl-tRNA synthetase  67.23 
 
 		 671 aa  865    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000566637 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12633  threonyl-tRNA synthetase  72.59 
 
 		 692 aa  1001    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3188  threonyl-tRNA synthetase  74.04 
 
 		 690 aa  1031    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3147  threonyl-tRNA synthetase  65.13 
 
 		 701 aa  875    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2392  threonyl-tRNA synthetase  67.21 
 
 		 668 aa  926    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451072  hitchhiker  0.00797277 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13900  threonyl-tRNA synthetase  69.34 
 
 		 666 aa  889    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0274631  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1656  threonyl-tRNA synthetase  61.28 
 
 		 672 aa  779    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291225  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2242  threonyl-tRNA synthetase  73.53 
 
 		 684 aa  1016    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15440  threonyl-tRNA synthetase  58.72 
 
 		 660 aa  753    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.374739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1764  threonyl-tRNA synthetase  65.96 
 
 		 658 aa  887    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279145  hitchhiker  0.00103927 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0448  threonyl-tRNA synthetase  62.58 
 
 		 677 aa  843    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.145335  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1919  threonyl-tRNA synthetase  72.3 
 
 		 677 aa  1027    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.615568  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2287  threonyl-tRNA synthetase  76 
 
 		 691 aa  1061    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12385  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1783  threonyl-tRNA synthetase  65.29 
 
 		 671 aa  873    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.491934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1378  threonyl-tRNA synthetase  63.3 
 
 		 673 aa  869    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0410171  normal  0.0241813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2317  threonyl-tRNA synthetase  67.03 
 
 		 669 aa  880    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104069  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1358  threonyl-tRNA synthetase  63.37 
 
 		 685 aa  843    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.462189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2370  threonyl-tRNA synthetase  62.81 
 
 		 668 aa  804    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2289  threonyl-tRNA synthetase  73.53 
 
 		 684 aa  1016    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2558  threonyl-tRNA synthetase  74.52 
 
 		 691 aa  1053    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2095  threonyl-tRNA synthetase  64.15 
 
 		 684 aa  851    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00031634  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3066  threonyl-tRNA synthetase  65.06 
 
 		 656 aa  835    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.408536  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17410  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  68.25 
 
 		 676 aa  875    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.595758  normal  0.0835389 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 644 aa  598  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 644 aa  598  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 648 aa  585  1e-166  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 		 643 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 645 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 649 aa  578  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 644 aa  579  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 636 aa  578  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 644 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 		 638 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 644 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 		 644 aa  572  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 646 aa  570  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 645 aa  566  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 659 aa  566  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 		 636 aa  565  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 636 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 636 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 643 aa  556  1e-157  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 604 aa  553  1e-156  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 644 aa  550  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0744  threonyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 581 aa  549  1e-155  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 644 aa  549  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 614 aa  547  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 583 aa  548  1e-154  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 596 aa  547  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 639 aa  547  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 635 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 635 aa  545  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 635 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 635 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 635 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 638 aa  545  1e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 635 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 635 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 635 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 635 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1229  threonyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 623 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 635 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 635 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 637 aa  538  9.999999999999999e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 635 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0349  threonyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 595 aa  538  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 635 aa  537  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 635 aa  537  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 635 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 635 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 		 635 aa  538  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 635 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 638 aa  533  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 635 aa  532  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 635 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0110  threonyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 595 aa  534  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 635 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 638 aa  530  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 640 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 		 634 aa  527  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 640 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 582 aa  525  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000323411  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 643 aa  528  1e-148  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0935  threonyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 611 aa  528  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0867221  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 639 aa  525  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>