More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0841 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0841  threonine--tRNA ligase  100 
 
 		 676 aa  1411    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10670  threonyl-tRNA synthetase  65.91 
 
 		 672 aa  903    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000327769  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1783  threonyl-tRNA synthetase  60.28 
 
 		 671 aa  789    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.491934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2095  threonyl-tRNA synthetase  58.5 
 
 		 684 aa  808    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00031634  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3188  threonyl-tRNA synthetase  61.87 
 
 		 690 aa  832    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3442  threonyl-tRNA synthetase  65.85 
 
 		 699 aa  858    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000446012  hitchhiker  0.0000744788 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2078  threonyl-tRNA synthetase  65.76 
 
 		 657 aa  900    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2281  threonyl-tRNA synthetase  62.69 
 
 		 684 aa  833    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1783  threonyl-tRNA synthetase  68.02 
 
 		 670 aa  930    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.0885436 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2287  threonyl-tRNA synthetase  64.65 
 
 		 691 aa  852    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12385  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3066  threonyl-tRNA synthetase  63.55 
 
 		 656 aa  867    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.408536  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2108  threonyl-tRNA synthetase  63.91 
 
 		 659 aa  866    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1378  threonyl-tRNA synthetase  65.56 
 
 		 673 aa  924    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0410171  normal  0.0241813 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15440  threonyl-tRNA synthetase  61.73 
 
 		 660 aa  838    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.374739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13900  threonyl-tRNA synthetase  66.06 
 
 		 666 aa  921    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0274631  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0448  threonyl-tRNA synthetase  84.65 
 
 		 677 aa  1202    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.145335  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2043  threonyl-tRNA synthetase  65.46 
 
 		 669 aa  916    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000086336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3838  threonyl-tRNA synthetase  63.48 
 
 		 695 aa  841    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.400381  normal  0.082381 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17410  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  66.11 
 
 		 676 aa  910    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.595758  normal  0.0835389 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2230  threonyl-tRNA synthetase  64.39 
 
 		 666 aa  886    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883238  hitchhiker  0.00000834751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2392  threonyl-tRNA synthetase  61.09 
 
 		 668 aa  805    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451072  hitchhiker  0.00797277 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1979  threonyl-tRNA synthetase  64.97 
 
 		 671 aa  895    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000566637 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3147  threonyl-tRNA synthetase  64.22 
 
 		 701 aa  880    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6132  threonyl-tRNA synthetase  61.95 
 
 		 659 aa  834    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158599  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1656  threonyl-tRNA synthetase  59.72 
 
 		 672 aa  798    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291225  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12633  threonyl-tRNA synthetase  64.56 
 
 		 692 aa  826    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1764  threonyl-tRNA synthetase  63.8 
 
 		 658 aa  879    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279145  hitchhiker  0.00103927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1770  threonyl-tRNA synthetase  60.95 
 
 		 671 aa  784    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0365193  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2089  threonyl-tRNA synthetase  65.4 
 
 		 682 aa  872    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2242  threonyl-tRNA synthetase  62.69 
 
 		 684 aa  833    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14910  threonyl-tRNA synthetase  62.75 
 
 		 692 aa  830    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3269  threonyl-tRNA synthetase  66.17 
 
 		 657 aa  908    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1919  threonyl-tRNA synthetase  63.29 
 
 		 677 aa  840    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.615568  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2317  threonyl-tRNA synthetase  65.76 
 
 		 669 aa  921    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104069  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1358  threonyl-tRNA synthetase  63.1 
 
 		 685 aa  862    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.462189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2370  threonyl-tRNA synthetase  58.53 
 
 		 668 aa  803    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2289  threonyl-tRNA synthetase  62.69 
 
 		 684 aa  833    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2558  threonyl-tRNA synthetase  63.69 
 
 		 691 aa  837    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 645 aa  586  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 648 aa  583  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 636 aa  581  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 636 aa  581  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 636 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 643 aa  575  1.0000000000000001e-162  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 		 636 aa  566  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 646 aa  568  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 645 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 643 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 644 aa  560  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 644 aa  560  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 		 638 aa  559  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0744  threonyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 581 aa  557  1e-157  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0359075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 604 aa  556  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 644 aa  558  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 644 aa  557  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 614 aa  553  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 644 aa  553  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 583 aa  553  1e-156  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 649 aa  552  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 		 639 aa  549  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 639 aa  551  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 596 aa  548  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 635 aa  547  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  46.4 
 
 		 582 aa  546  1e-154  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0753  threonyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 582 aa  542  1e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.105849  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 644 aa  542  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 		 638 aa  543  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0935  threonyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 611 aa  545  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0867221  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1034  threonyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 611 aa  543  1e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 582 aa  543  1e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000323411  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 659 aa  545  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 635 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 		 644 aa  544  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1457  threonyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 608 aa  541  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 		 638 aa  539  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 637 aa  538  1e-151  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 634 aa  535  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 634 aa  536  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 631 aa  532  1e-150  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 633 aa  534  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 644 aa  535  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 635 aa  532  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 640 aa  529  1e-149  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 662 aa  529  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 608 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 648 aa  530  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0387  threonyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 610 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.677095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 640 aa  528  1e-148  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2787  threonyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 		 615 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0110  threonyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 595 aa  525  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 647 aa  525  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 635 aa  525  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 637 aa  522  1e-147  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 645 aa  524  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 641 aa  523  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 635 aa  525  1e-147  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 640 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 640 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 635 aa  521  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 634 aa  519  1e-146  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>