More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_33493 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  55.19 
 
 		 643 aa  693    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 644 aa  710    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  53.17 
 
 		 638 aa  682    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 		 614 aa  774    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2787  threonyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 615 aa  663    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 		 644 aa  673    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0935  threonyl-tRNA synthetase  60.03 
 
 		 611 aa  785    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0867221  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1034  threonyl-tRNA synthetase  60.92 
 
 		 611 aa  783    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2606  threonyl-tRNA synthetase  53.53 
 
 		 604 aa  677    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0580419 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0731  threonyl-tRNA synthetase  50.98 
 
 		 607 aa  652    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_46103  predicted protein  64.4 
 
 		 564 aa  775    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.036188 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2841  threonyl-tRNA synthetase  52.67 
 
 		 606 aa  656    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 608 aa  663    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0760  threonyl-tRNA synthetase  50.98 
 
 		 607 aa  652    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.281808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 644 aa  710    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0387  threonyl-tRNA synthetase  51.5 
 
 		 610 aa  655    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.677095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1457  threonyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 		 608 aa  662    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 648 aa  662    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33493  predicted protein  100 
 
 		 684 aa  1417    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 		 644 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 645 aa  601  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 636 aa  600  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  51.89 
 
 		 582 aa  598  1e-170  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 644 aa  598  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 643 aa  598  1e-170  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  52.06 
 
 		 582 aa  597  1e-169  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000323411  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0753  threonyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 		 582 aa  593  1e-168  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.105849  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 636 aa  593  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 		 635 aa  589  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 649 aa  591  1e-167  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 645 aa  589  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 646 aa  590  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 638 aa  586  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 635 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 644 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 		 636 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 636 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 		 647 aa  579  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 634 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 635 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 583 aa  577  1.0000000000000001e-163  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 633 aa  571  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 634 aa  568  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0744  threonyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 581 aa  566  1e-160  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 635 aa  567  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 644 aa  568  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 644 aa  565  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 638 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 		 659 aa  562  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 		 635 aa  565  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 637 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 		 631 aa  560  1e-158  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 637 aa  558  1e-157  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 641 aa  556  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 604 aa  554  1e-156  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 635 aa  548  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 640 aa  551  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0028  threonyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 603 aa  550  1e-155  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 636 aa  546  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 638 aa  546  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 635 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 635 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 635 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 643 aa  545  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 635 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 635 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 635 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 635 aa  547  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 635 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 635 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2368  threonyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 644 aa  546  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.642893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 640 aa  542  1e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0033  threonyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 641 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.611945  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 640 aa  542  1e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 635 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 635 aa  544  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 636 aa  543  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 641 aa  545  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1745  threonyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 637 aa  543  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239329 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1577  threonyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 635 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06531  threonyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 640 aa  541  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 637 aa  539  9.999999999999999e-153  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3538  threonyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 648 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.211804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2078  threonyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 657 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2035  threonyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 686 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 639 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5204  threonyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 688 aa  541  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144339 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 669 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 635 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 635 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 637 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 635 aa  538  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 640 aa  538  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2095  threonyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 684 aa  538  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00031634  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2168  threonyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 661 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.762302  normal  0.0294607 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 635 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 635 aa  538  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 635 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 635 aa  538  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 662 aa  536  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>