More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4760 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4760  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 628 aa  1298    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0619486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 639 aa  548  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 645 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 635 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 		 645 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 637 aa  539  9.999999999999999e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 636 aa  535  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 		 636 aa  535  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 659 aa  534  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 638 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 631 aa  530  1e-149  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 644 aa  530  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4204  threonyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 736 aa  528  1e-148  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 		 635 aa  526  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 633 aa  527  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 608 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 		 635 aa  528  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 648 aa  527  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 634 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 644 aa  523  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2483  threonyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 637 aa  525  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0764303  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 662 aa  522  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 644 aa  524  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 		 646 aa  524  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 636 aa  521  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 646 aa  519  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 583 aa  521  1e-146  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0330  threonyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 606 aa  521  1e-146  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000295964  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1819  threonyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 606 aa  521  1e-146  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.196151  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 638 aa  521  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 640 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 604 aa  516  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 644 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0935  threonyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 611 aa  518  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0867221  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 		 643 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 635 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 635 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 649 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 640 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 636 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 635 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33493  predicted protein  44.14 
 
 		 684 aa  517  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 639 aa  513  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 639 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0081  threonyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 605 aa  514  1e-144  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000716431  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 639 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 638 aa  512  1e-144  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 635 aa  513  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0611  threonyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 609 aa  514  1e-144  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.260291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 634 aa  514  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 636 aa  515  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 639 aa  511  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 639 aa  509  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 644 aa  510  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 644 aa  510  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 		 640 aa  509  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0028  threonyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 603 aa  509  1e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1732  threonyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 630 aa  511  1e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 640 aa  510  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 639 aa  511  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 643 aa  509  1e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 640 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0199  threonyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 602 aa  508  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 639 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0216  threonyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 602 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 614 aa  506  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1034  threonyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 611 aa  507  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2606  threonyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 604 aa  507  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0580419 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 637 aa  507  9.999999999999999e-143  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0238  threonyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 602 aa  507  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 641 aa  506  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 		 644 aa  506  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 640 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3623  threonyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 643 aa  505  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 637 aa  503  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 596 aa  503  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 639 aa  504  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1457  threonyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 608 aa  505  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 635 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 635 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 635 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2787  threonyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 615 aa  500  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 635 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2230  threonyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 666 aa  499  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883238  hitchhiker  0.00000834751 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 638 aa  501  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 635 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 635 aa  499  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 635 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 635 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1448  threonyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 639 aa  496  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 635 aa  498  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 640 aa  496  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 635 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 636 aa  498  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 635 aa  495  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17410  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  42.92 
 
 		 676 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.595758  normal  0.0835389 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1319  hypothetical protein  41.6 
 
 		 586 aa  496  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1702  threonyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 617 aa  497  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000310236  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 644 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 639 aa  497  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>