More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1319 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 
640 aa  636    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 
635 aa  691    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  56.72 
 
 
634 aa  691    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  55.26 
 
 
639 aa  678    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0627  threonyl-tRNA synthetase  62.01 
 
 
588 aa  796    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2665  threonyl-tRNA synthetase  57.95 
 
 
584 aa  714    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220787  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04450  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  61.54 
 
 
586 aa  799    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0386598  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 
635 aa  726    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 
640 aa  637    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  56.36 
 
 
637 aa  672    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 
638 aa  639    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  58.84 
 
 
634 aa  710    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 
631 aa  649    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 
633 aa  689    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 
640 aa  647    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  56.44 
 
 
635 aa  676    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1319  hypothetical protein  100 
 
 
586 aa  1227    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  57.5 
 
 
635 aa  699    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  60.28 
 
 
635 aa  736    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16370  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  62.74 
 
 
586 aa  818    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.12349 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 
640 aa  634  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 
636 aa  629  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  51.31 
 
 
639 aa  629  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 
639 aa  629  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  51.66 
 
 
639 aa  631  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 
645 aa  629  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  51.31 
 
 
639 aa  629  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 
640 aa  629  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 
639 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 
639 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 
639 aa  627  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 
636 aa  624  1e-177  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 
636 aa  619  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  51.05 
 
 
637 aa  619  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 
640 aa  619  1e-176  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  51.56 
 
 
640 aa  619  1e-176  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 
634 aa  613  9.999999999999999e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 
645 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 
643 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  50.88 
 
 
636 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 
636 aa  601  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  51.08 
 
 
644 aa  596  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  50.97 
 
 
646 aa  596  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  50.88 
 
 
636 aa  591  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
640 aa  583  1.0000000000000001e-165  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 
633 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 
638 aa  579  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 
644 aa  579  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 
640 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
644 aa  575  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
642 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 
644 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 
640 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 
643 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
638 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 
647 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3623  threonyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 
643 aa  573  1.0000000000000001e-162  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 
648 aa  571  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 
638 aa  567  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  46 
 
 
640 aa  566  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
643 aa  567  1e-160  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 
636 aa  568  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20420  threonyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
640 aa  565  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
644 aa  565  1e-160  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 
644 aa  565  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 
640 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 
644 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2417  threonyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
644 aa  565  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00010604  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 
644 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 
640 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1967  threonyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 
640 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134711  normal  0.0132251 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2098  threonyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 
644 aa  560  1e-158  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000824061  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1931  threonyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 
640 aa  560  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0165537  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18621  threonyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 
640 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
641 aa  559  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2465  threonyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
640 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0717195  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
637 aa  556  1e-157  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3481  threonyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
640 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800828  normal  0.0249513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3225  threonyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
640 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.529889 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
641 aa  556  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10531  threonyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 
638 aa  558  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.487806  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0870  threonyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
635 aa  555  1e-156  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
637 aa  554  1e-156  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 
644 aa  554  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  47 
 
 
640 aa  552  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
649 aa  552  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1951  threonyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 
642 aa  552  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250897  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01688  threonyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
642 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1923  threonyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
642 aa  550  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000181503  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2437  threonyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 
642 aa  549  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00126815  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003716  threonyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
642 aa  549  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000263633  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1913  threonyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 
642 aa  548  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.121147  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1472  threonyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
642 aa  550  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000205456  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06531  threonyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
640 aa  548  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 
635 aa  550  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01677  hypothetical protein  47.31 
 
 
642 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0538316  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1800  threonyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 
642 aa  548  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000021107  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 
637 aa  550  1e-155  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1937  threonyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 
642 aa  548  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227542  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2219  threonyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
635 aa  550  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00166056  normal  0.0562711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>