More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0870 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0870  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 635 aa  1323    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 637 aa  647    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 635 aa  635    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 634 aa  639    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 635 aa  637    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 		 637 aa  655    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 635 aa  648    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 		 634 aa  632  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 635 aa  634  1e-180  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 636 aa  628  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 635 aa  620  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 639 aa  618  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 640 aa  618  1e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 640 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2665  threonyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 584 aa  609  1e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220787  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 633 aa  608  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 634 aa  596  1e-169  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 636 aa  592  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 639 aa  589  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 643 aa  590  1e-167  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 636 aa  585  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 636 aa  586  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 640 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 639 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 		 640 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 640 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 639 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 639 aa  581  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 639 aa  580  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 		 645 aa  579  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 639 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 643 aa  578  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 640 aa  578  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 639 aa  581  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 636 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 638 aa  575  1.0000000000000001e-163  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 640 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 631 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 645 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 646 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 633 aa  574  1.0000000000000001e-162  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 637 aa  568  1e-161  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 644 aa  569  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 644 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 635 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 640 aa  562  1.0000000000000001e-159  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 644 aa  561  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0627  threonyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 588 aa  558  1e-157  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 635 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 635 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 641 aa  555  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 644 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 635 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 648 aa  557  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 644 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 635 aa  555  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 644 aa  553  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 635 aa  555  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 635 aa  555  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 635 aa  555  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 635 aa  555  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 636 aa  553  1e-156  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 638 aa  554  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 635 aa  555  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 635 aa  555  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 635 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 638 aa  551  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 638 aa  550  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 635 aa  551  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1319  hypothetical protein  46.91 
 
 		 586 aa  550  1e-155  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 635 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 635 aa  551  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04450  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  46.47 
 
 		 586 aa  548  1e-154  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0386598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 635 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 638 aa  546  1e-154  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 635 aa  545  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16370  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  47.72 
 
 		 586 aa  544  1e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.12349 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  43.26 
 
 		 638 aa  542  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 		 644 aa  542  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 638 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 636 aa  539  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 635 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 635 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 641 aa  539  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1577  threonyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 635 aa  538  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704052  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 637 aa  537  1e-151  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 635 aa  537  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 649 aa  538  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 644 aa  537  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 635 aa  538  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 637 aa  535  1e-150  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0033  threonyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 641 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.611945  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 635 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 642 aa  533  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 640 aa  535  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 644 aa  531  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 635 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2149  threonyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 641 aa  529  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0081  threonyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 605 aa  528  1e-149  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000716431  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 644 aa  531  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.975747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>