More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0392 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 635 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 		 640 aa  658    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2154  threonyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 		 661 aa  649    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  54.96 
 
 		 639 aa  753    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  49.52 
 
 		 636 aa  665    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 646 aa  650    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1888  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 635 aa  639    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150098 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 635 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  49.12 
 
 		 649 aa  654    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  51.66 
 
 		 639 aa  693    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1577  threonyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 635 aa  635    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 		 640 aa  691    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 		 644 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3025  threonyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 638 aa  640    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 		 645 aa  664    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5204  threonyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 688 aa  667    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144339 
 
 
-
 
NC_004310  BR1071  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 658 aa  644    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 635 aa  662    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 635 aa  660    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 		 639 aa  691    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  54.99 
 
 		 634 aa  720    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 639 aa  694    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1638  threonyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 		 660 aa  649    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.360122  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 		 639 aa  694    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  50.58 
 
 		 637 aa  649    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 635 aa  659    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 640 aa  690    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 640 aa  637    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  51.58 
 
 		 635 aa  694    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 		 637 aa  708    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 631 aa  669    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 635 aa  663    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1448  threonyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 639 aa  636    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  51.15 
 
 		 647 aa  637    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2035  threonyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 686 aa  642    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3886  threonyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 687 aa  649    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 635 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  69.87 
 
 		 634 aa  954    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 636 aa  650    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 635 aa  665    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 		 638 aa  638    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 635 aa  658    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 		 644 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 635 aa  658    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 645 aa  662    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  50.32 
 
 		 644 aa  656    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 642 aa  653    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 		 639 aa  691    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 636 aa  675    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 		 640 aa  647    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 635 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 638 aa  650    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 639 aa  694    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  53.25 
 
 		 633 aa  711    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 635 aa  657    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3538  threonyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 648 aa  654    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.211804 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2168  threonyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 		 661 aa  640    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.762302  normal  0.0294607 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 635 aa  659    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1010  threonyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 640 aa  647    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4616  threonyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 643 aa  644    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213357 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 633 aa  1311    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 669 aa  649    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 636 aa  643    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 644 aa  649    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 635 aa  660    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 635 aa  640    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 635 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 		 635 aa  749    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 634 aa  722    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1035  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 693 aa  643    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.233676  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 		 635 aa  707    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2668  threonyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 		 652 aa  657    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.107403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 635 aa  659    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 640 aa  647    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2368  threonyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 644 aa  686    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.642893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 635 aa  650    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 635 aa  649    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 635 aa  657    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 644 aa  647    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 636 aa  651    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1007  threonyl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 656 aa  649    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585418  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 635 aa  659    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 640 aa  686    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 636 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 639 aa  689    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 635 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  55.68 
 
 		 635 aa  749    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 641 aa  654    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 640 aa  650    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 635 aa  729    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 644 aa  638    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 		 635 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 635 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 639 aa  636    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 640 aa  655    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 635 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 		 644 aa  644    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 648 aa  657    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2211  threonyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 		 666 aa  635    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.920891  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0641  threonyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 658 aa  660    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>