More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1415 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1863  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  71.97 
 
 		 601 aa  862    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  55.8 
 
 		 645 aa  733    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 645 aa  751    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  57.3 
 
 		 652 aa  751    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  58.69 
 
 		 647 aa  791    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 		 645 aa  753    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 645 aa  751    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 645 aa  751    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 645 aa  751    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 643 aa  758    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 645 aa  751    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 		 648 aa  673    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  57.61 
 
 		 644 aa  765    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 645 aa  751    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  55.4 
 
 		 645 aa  728    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 645 aa  751    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 		 645 aa  753    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2181  threonyl-tRNA synthetase  59.13 
 
 		 646 aa  808    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0460  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  53.25 
 
 		 663 aa  698    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0696284  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1415  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 643 aa  1317    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260393 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0662  threonyl-tRNA synthetase  59.32 
 
 		 652 aa  794    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  58.01 
 
 		 648 aa  782    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 645 aa  751    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  55.4 
 
 		 645 aa  728    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 596 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 635 aa  536  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 646 aa  537  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl177  threonyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 644 aa  535  1e-150  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 662 aa  533  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 639 aa  529  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 639 aa  527  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 647 aa  524  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 640 aa  521  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 640 aa  521  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 639 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 640 aa  520  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 639 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 640 aa  521  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 639 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 643 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 639 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 639 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 639 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1373  threonyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 645 aa  512  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000340223  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 635 aa  514  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 640 aa  515  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 644 aa  513  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 639 aa  513  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 640 aa  511  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 642 aa  510  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 		 638 aa  511  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2631  threonyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 643 aa  510  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2317  threonyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 643 aa  511  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0626  threonyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 580 aa  506  9.999999999999999e-143  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 648 aa  508  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1192  threonyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 		 652 aa  503  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 635 aa  503  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 659 aa  500  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 634 aa  496  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 641 aa  495  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0222  threonyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 639 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 634 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 636 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 646 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 635 aa  491  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 636 aa  490  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 637 aa  485  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 635 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 635 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 635 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 644 aa  486  1e-136  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 633 aa  486  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 640 aa  487  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 649 aa  488  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 645 aa  485  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 635 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 653 aa  483  1e-135  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 635 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 637 aa  485  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 		 635 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 635 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 635 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 643 aa  484  1e-135  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 635 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 635 aa  485  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 635 aa  482  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 635 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 635 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 635 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 635 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 635 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 644 aa  481  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 635 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 635 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 635 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 636 aa  481  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 635 aa  480  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 604 aa  479  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 644 aa  481  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 635 aa  482  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>