More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0349 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0349  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
595 aa  1219    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129605  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  58.67 
 
 
604 aa  717    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  55.96 
 
 
596 aa  639    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0110  threonyl-tRNA synthetase  93.95 
 
 
595 aa  1159    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2511  threonyl-tRNA synthetase  75.13 
 
 
594 aa  929    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0678043  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  62.35 
 
 
639 aa  715    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
638 aa  568  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 
640 aa  569  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
643 aa  565  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
644 aa  568  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
644 aa  568  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 
662 aa  568  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 
649 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0731  threonyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
607 aa  558  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0760  threonyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
607 aa  558  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.281808  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
608 aa  558  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 
646 aa  558  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 
635 aa  557  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1010  threonyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
640 aa  558  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
636 aa  556  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
635 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
635 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0387  threonyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
610 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.677095  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
635 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
635 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18621  threonyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 
640 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2078  threonyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 
657 aa  554  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1799  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  47.76 
 
 
632 aa  552  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302616  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
644 aa  552  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
635 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 
648 aa  555  1e-156  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
635 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
635 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
645 aa  549  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6132  threonyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
659 aa  549  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158599  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 
644 aa  549  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
635 aa  550  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
636 aa  548  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 
652 aa  547  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 
614 aa  545  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
635 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2606  threonyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
604 aa  546  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0580419 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 
648 aa  545  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
582 aa  547  1e-154  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000323411  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
648 aa  546  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 
638 aa  542  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2108  threonyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
659 aa  543  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1007  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
637 aa  542  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.245371  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2392  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
668 aa  542  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451072  hitchhiker  0.00797277 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 
635 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 
645 aa  542  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
638 aa  542  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2230  threonyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 
666 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883238  hitchhiker  0.00000834751 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 
641 aa  545  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3269  threonyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
657 aa  544  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 
635 aa  543  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0753  threonyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 
582 aa  541  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.105849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 
636 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2787  threonyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
615 aa  541  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100504  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
635 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3147  threonyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 
701 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
635 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0744  threonyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 
581 aa  540  9.999999999999999e-153  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
635 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1358  threonyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 
685 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.462189 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
641 aa  541  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
640 aa  535  1e-151  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
635 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 
635 aa  538  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
647 aa  538  1e-151  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1764  threonyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
658 aa  536  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279145  hitchhiker  0.00103927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14910  threonyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
692 aa  538  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
635 aa  536  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  47.86 
 
 
638 aa  538  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  47.95 
 
 
582 aa  538  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 
635 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2095  threonyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
684 aa  537  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00031634  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 
635 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1457  threonyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 
608 aa  538  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 
637 aa  535  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 
635 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
644 aa  536  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 
644 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 
644 aa  535  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 
635 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
636 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2089  threonyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 
682 aa  532  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
644 aa  532  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 
637 aa  533  1e-150  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 
637 aa  535  1e-150  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 
583 aa  534  1e-150  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
635 aa  535  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
635 aa  535  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
659 aa  534  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3025  threonyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 
638 aa  534  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
635 aa  533  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  47 
 
 
636 aa  534  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 
640 aa  533  1e-150  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 
645 aa  530  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3442  threonyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 
699 aa  531  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000446012  hitchhiker  0.0000744788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>