More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1863 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 		 645 aa  643    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 645 aa  667    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1863  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  100 
 
 		 601 aa  1241    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  58.47 
 
 		 647 aa  725    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 645 aa  667    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 645 aa  667    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 645 aa  667    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 		 652 aa  665    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 645 aa  667    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 		 645 aa  665    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 645 aa  667    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 		 645 aa  664    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  55.77 
 
 		 644 aa  675    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 645 aa  667    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2181  threonyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 		 646 aa  728    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0460  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  54.12 
 
 		 663 aa  657    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0696284  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1415  threonyl-tRNA synthetase  71.97 
 
 		 643 aa  871    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260393 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0662  threonyl-tRNA synthetase  58.43 
 
 		 652 aa  734    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  56.81 
 
 		 648 aa  710    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 645 aa  667    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 		 645 aa  654    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  56.43 
 
 		 643 aa  674    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 		 645 aa  654    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  52.6 
 
 		 648 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 596 aa  533  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 662 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 639 aa  483  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 646 aa  473  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl177  threonyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 644 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2631  threonyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 643 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2317  threonyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 643 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1373  threonyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 645 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000340223  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 		 644 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0626  threonyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 580 aa  467  9.999999999999999e-131  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 635 aa  465  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 639 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 604 aa  459  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 634 aa  456  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 639 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 640 aa  457  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 635 aa  458  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 639 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 639 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1192  threonyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 652 aa  452  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 646 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 639 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 647 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 640 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 639 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 659 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 		 643 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 641 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 640 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 647 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 640 aa  450  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 647 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 639 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 648 aa  449  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 640 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 636 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 645 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 639 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 653 aa  445  1e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 640 aa  442  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 657 aa  445  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0992  threonyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 647 aa  444  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 648 aa  442  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 638 aa  443  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0627  threonyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 588 aa  444  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0222  threonyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 639 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0982  threonyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 652 aa  440  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0768948  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 638 aa  439  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 657 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 635 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 643 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 638 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0349  threonyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 		 595 aa  436  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129605  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 637 aa  437  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 637 aa  438  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 		 642 aa  436  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 649 aa  436  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 637 aa  436  1e-121  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0110  threonyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 595 aa  433  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 677 aa  435  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 		 657 aa  434  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 659 aa  430  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 608 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 		 675 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 635 aa  427  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 634 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 644 aa  427  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 633 aa  428  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0024  threonyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 648 aa  425  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 634 aa  425  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 582 aa  422  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000323411  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  37.48 
 
 		 643 aa  422  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf704  threonyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 579 aa  424  1e-117  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 583 aa  423  1e-117  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 635 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 644 aa  424  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>