More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1347 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1554  putative threonyl-tRNA synthetase/uridine kinase  97.46 
 
 		 551 aa  1058    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.614355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1347  phosphoribulokinase / uridine kinase family protein  100 
 
 		 551 aa  1111    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0332  phosphoribulokinase/uridine kinase  49.62 
 
 		 557 aa  489  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3519  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.1 
 
 		 553 aa  488  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3162  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.64 
 
 		 552 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1290  phosphoribulokinase/uridine kinase  49.42 
 
 		 547 aa  479  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.297478  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0531  AAA ATPase  48.65 
 
 		 554 aa  479  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.777332  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1435  AAA ATPase  45.99 
 
 		 552 aa  477  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0041  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.16 
 
 		 554 aa  472  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.448598  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10770  uridine kinase  45.69 
 
 		 549 aa  464  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.14 
 
 		 558 aa  452  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1101  uridine kinase  46.37 
 
 		 557 aa  452  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1763  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.76 
 
 		 559 aa  435  1e-120  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.295373  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0178  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.2 
 
 		 555 aa  429  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.871097  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0176  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.02 
 
 		 555 aa  426  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0833476  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1361  AAA ATPase  41.2 
 
 		 547 aa  423  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.762498  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.09 
 
 		 555 aa  416  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1435  phosphoribulokinase/uridine kinase  42.17 
 
 		 553 aa  417  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2238  phosphoribulokinase/uridine kinase  39.85 
 
 		 567 aa  409  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.958517  normal  0.150287 
 
 
-
 
NC_002950  PG1745  phosphoribulokinase family protein  42.63 
 
 		 529 aa  406  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2289  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  38.33 
 
 		 550 aa  358  1.9999999999999998e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  42.05 
 
 		 462 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3852  cyclic nucleotide-binding protein  32.61 
 
 		 713 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.8 
 
 		 714 aa  261  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3863  cyclic nucleotide-binding protein  32.68 
 
 		 715 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3780  cyclic nucleotide-binding protein  32.68 
 
 		 715 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12201  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 		 643 aa  77.8  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 		 638 aa  75.1  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1373  threonyl-tRNA synthetase  29.05 
 
 		 645 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000340223  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  27.95 
 
 		 635 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  27.91 
 
 		 640 aa  68.2  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  25.97 
 
 		 662 aa  67.8  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 640 aa  67.8  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 638 aa  67.8  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  27.86 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  25.62 
 
 		 633 aa  67.4  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  29.34 
 
 		 635 aa  67.4  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  27.72 
 
 		 208 aa  67  0.0000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  26.71 
 
 		 638 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  28.41 
 
 		 204 aa  65.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 631 aa  66.2  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 		 646 aa  64.7  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  21.16 
 
 		 639 aa  64.3  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  26.53 
 
 		 638 aa  63.9  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  24.2 
 
 		 659 aa  63.9  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 		 640 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0978  threonyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 633 aa  63.2  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  26.35 
 
 		 640 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 645 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  26.55 
 
 		 212 aa  63.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  25.77 
 
 		 639 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 645 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  25.77 
 
 		 639 aa  63.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 645 aa  63.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 645 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  25.77 
 
 		 639 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 645 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 645 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 645 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  25.15 
 
 		 639 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 645 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  25.77 
 
 		 639 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  27.7 
 
 		 643 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 		 644 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  26.24 
 
 		 644 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  25.75 
 
 		 639 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 640 aa  62.4  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  26.74 
 
 		 219 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  30.38 
 
 		 645 aa  62  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1493  uridine kinase  26.11 
 
 		 196 aa  62  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.54247 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  30.38 
 
 		 645 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  25.79 
 
 		 636 aa  62  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  26.49 
 
 		 635 aa  61.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  25.75 
 
 		 640 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3931  phosphoribulokinase  27.69 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3980  phosphoribulokinase  27.69 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000234967  decreased coverage  0.00010781 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 		 643 aa  61.2  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 		 657 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 		 635 aa  60.5  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2465  threonyl-tRNA synthetase  28.3 
 
 		 640 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2617  uridine kinase  26.2 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3481  threonyl-tRNA synthetase  28.3 
 
 		 640 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800828  normal  0.0249513 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1657  uridine kinase  26.2 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0722731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1732  uridine kinase  26.2 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000414727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1762  uridine kinase  26.2 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0067733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  26.22 
 
 		 504 aa  60.1  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  26.55 
 
 		 207 aa  59.7  0.0000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 		 638 aa  59.7  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  22.7 
 
 		 635 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  24.75 
 
 		 647 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  24.2 
 
 		 638 aa  59.3  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 635 aa  59.3  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0641  threonyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 		 658 aa  58.5  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  23.18 
 
 		 636 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1478  threonyl-tRNA synthetase  23.78 
 
 		 660 aa  58.5  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000148351  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3225  threonyl-tRNA synthetase  27.67 
 
 		 640 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.529889 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  25.71 
 
 		 645 aa  58.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  27.21 
 
 		 633 aa  58.5  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1415  threonyl-tRNA synthetase  24 
 
 		 660 aa  58.5  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000939714  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  24.74 
 
 		 637 aa  58.2  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>