216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3519 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3519  phosphoribulokinase/uridine kinase  100 
 
 		 553 aa  1142    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0332  phosphoribulokinase/uridine kinase  48.1 
 
 		 557 aa  526  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0176  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.2 
 
 		 555 aa  499  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0833476  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0178  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.51 
 
 		 555 aa  499  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.871097  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.25 
 
 		 558 aa  500  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1290  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.09 
 
 		 547 aa  497  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.297478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10770  uridine kinase  45.47 
 
 		 549 aa  479  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0041  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.86 
 
 		 554 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.448598  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1554  putative threonyl-tRNA synthetase/uridine kinase  46.46 
 
 		 551 aa  477  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.614355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1347  phosphoribulokinase / uridine kinase family protein  46.1 
 
 		 551 aa  478  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0531  AAA ATPase  45.79 
 
 		 554 aa  478  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.777332  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1435  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.19 
 
 		 553 aa  468  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1435  AAA ATPase  44.06 
 
 		 552 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3162  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.32 
 
 		 552 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1763  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.03 
 
 		 559 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.295373  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1101  uridine kinase  42.75 
 
 		 557 aa  455  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1361  AAA ATPase  39.6 
 
 		 547 aa  436  1e-121  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.762498  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1745  phosphoribulokinase family protein  41.52 
 
 		 529 aa  432  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2238  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.81 
 
 		 567 aa  430  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.958517  normal  0.150287 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2289  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  41.5 
 
 		 550 aa  407  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  40.73 
 
 		 555 aa  392  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  40.45 
 
 		 462 aa  359  9e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3863  cyclic nucleotide-binding protein  34.22 
 
 		 715 aa  281  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3852  cyclic nucleotide-binding protein  33.27 
 
 		 713 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3780  cyclic nucleotide-binding protein  33.46 
 
 		 715 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12201  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.9 
 
 		 714 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 		 633 aa  78.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  27.04 
 
 		 635 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 		 640 aa  74.3  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 		 640 aa  73.9  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1493  uridine kinase  30.65 
 
 		 196 aa  72  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.54247 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 		 639 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 638 aa  71.2  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  29.25 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  27.18 
 
 		 640 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  25.37 
 
 		 647 aa  68.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 639 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 639 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 639 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 639 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 640 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  26.15 
 
 		 639 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  26.77 
 
 		 208 aa  66.2  0.000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  24.49 
 
 		 634 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  22.68 
 
 		 635 aa  65.1  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  25.64 
 
 		 639 aa  64.7  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  26.15 
 
 		 640 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 		 645 aa  63.9  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  26.13 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1385  uridine kinase  27.14 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  29 
 
 		 202 aa  63.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 635 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  27.71 
 
 		 211 aa  62  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  21.32 
 
 		 637 aa  62  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2552  uridine kinase  30 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3195  uridine kinase  30 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0472319  hitchhiker  0.00149984 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2453  uridine kinase  30 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  21.13 
 
 		 662 aa  60.8  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  25.76 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  22.96 
 
 		 635 aa  60.5  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1422  uridine kinase  25.13 
 
 		 236 aa  60.1  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  21.94 
 
 		 636 aa  60.1  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  28.36 
 
 		 640 aa  58.9  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1576  uridine kinase  29 
 
 		 213 aa  59.3  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.435743 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  25.25 
 
 		 646 aa  59.3  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  22.39 
 
 		 635 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  24.35 
 
 		 645 aa  58.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1365  uridine kinase  25.87 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.759935  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  24.35 
 
 		 645 aa  58.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1373  threonyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 645 aa  57.8  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000340223  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  25.71 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2249  uridine kinase  28 
 
 		 213 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2463  uridine kinase  28 
 
 		 213 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.92076  normal  0.601786 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2871  uridine kinase  28 
 
 		 213 aa  57  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2349  uridine kinase  28 
 
 		 213 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2356  uridine kinase  28 
 
 		 213 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0747859  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  25.53 
 
 		 207 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  25.53 
 
 		 207 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  25.97 
 
 		 219 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2305  uridine kinase  28 
 
 		 213 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2317  threonyl-tRNA synthetase  24.5 
 
 		 643 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  25.85 
 
 		 504 aa  55.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 640 aa  56.2  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1197  uridine kinase  28 
 
 		 213 aa  55.5  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0422  uridine kinase  28.33 
 
 		 207 aa  55.1  0.000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.174111  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  29.34 
 
 		 207 aa  55.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2631  threonyl-tRNA synthetase  24.5 
 
 		 643 aa  55.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  27.5 
 
 		 219 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1215  uridine kinase  30.77 
 
 		 218 aa  55.1  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000175656  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10398  predicted protein  27.27 
 
 		 209 aa  55.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296577  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  22 
 
 		 644 aa  55.1  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0453  uridine kinase  25.3 
 
 		 201 aa  54.7  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00211906  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2228  uridine kinase  25.37 
 
 		 215 aa  54.3  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  26.56 
 
 		 207 aa  54.3  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1979  uridine kinase  27.64 
 
 		 211 aa  54.3  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  hitchhiker  0.00165825 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  21.54 
 
 		 677 aa  53.9  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1740  uridine kinase  27.27 
 
 		 208 aa  53.9  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.627897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  22.5 
 
 		 645 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  23.5 
 
 		 207 aa  53.9  0.000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  22.5 
 
 		 645 aa  53.9  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>