More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0531 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0531  AAA ATPase  100 
 
 
554 aa  1131    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.777332  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0332  phosphoribulokinase/uridine kinase  55.43 
 
 
557 aa  571  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1290  phosphoribulokinase/uridine kinase  51.85 
 
 
547 aa  543  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.297478  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1435  AAA ATPase  50.46 
 
 
552 aa  524  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10770  uridine kinase  51.07 
 
 
549 aa  497  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3162  phosphoribulokinase/uridine kinase  50 
 
 
552 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1763  phosphoribulokinase/uridine kinase  48.82 
 
 
559 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.295373  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0176  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.87 
 
 
555 aa  489  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0833476  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1101  uridine kinase  48.69 
 
 
557 aa  491  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0178  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.96 
 
 
555 aa  489  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.871097  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1361  AAA ATPase  45.11 
 
 
547 aa  482  1e-135  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.762498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0041  phosphoribulokinase/uridine kinase  48.36 
 
 
554 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.448598  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.54 
 
 
558 aa  478  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3519  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.79 
 
 
553 aa  478  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1435  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.14 
 
 
553 aa  469  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1347  phosphoribulokinase / uridine kinase family protein  48.65 
 
 
551 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1554  putative threonyl-tRNA synthetase/uridine kinase  47.88 
 
 
551 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.614355  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.98 
 
 
555 aa  442  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2238  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.12 
 
 
567 aa  422  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.958517  normal  0.150287 
 
 
-
 
NC_002950  PG1745  phosphoribulokinase family protein  43 
 
 
529 aa  405  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2289  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  42.72 
 
 
550 aa  408  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.94 
 
 
462 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3852  cyclic nucleotide-binding protein  32.38 
 
 
713 aa  289  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108661  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3863  cyclic nucleotide-binding protein  33.39 
 
 
715 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.69 
 
 
714 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3780  cyclic nucleotide-binding protein  33.39 
 
 
715 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 
639 aa  96.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 
646 aa  93.6  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
640 aa  85.9  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  29.13 
 
 
639 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 
640 aa  85.1  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  29.13 
 
 
639 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 
633 aa  85.1  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  30.51 
 
 
644 aa  84.7  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  30.51 
 
 
644 aa  84.7  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 
635 aa  84.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  29.13 
 
 
639 aa  84  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  29.13 
 
 
639 aa  84  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2668  threonyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 
652 aa  83.6  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.107403  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 
639 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  29.13 
 
 
639 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  25.87 
 
 
647 aa  82.4  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 
640 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  30.49 
 
 
641 aa  82  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  26.73 
 
 
640 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  29.13 
 
 
640 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  29.19 
 
 
640 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  29.21 
 
 
645 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 
635 aa  81.6  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  29.21 
 
 
645 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  29.21 
 
 
645 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  28.16 
 
 
639 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  29.21 
 
 
645 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  29.21 
 
 
645 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  29.21 
 
 
645 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  29.21 
 
 
645 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  29.21 
 
 
645 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  29.21 
 
 
645 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  29.21 
 
 
645 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1415  threonyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 
660 aa  80.5  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000939714  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  29.52 
 
 
637 aa  80.5  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24771  predicted protein  26.83 
 
 
674 aa  80.5  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.246652  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  29.52 
 
 
638 aa  80.1  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  28.22 
 
 
643 aa  80.1  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1478  threonyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 
660 aa  79.7  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000148351  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  25.76 
 
 
635 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  29.5 
 
 
648 aa  79.7  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  28.92 
 
 
637 aa  79  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 
644 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 
644 aa  79  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  27.5 
 
 
643 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  30.72 
 
 
635 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  32.3 
 
 
644 aa  79  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  24.75 
 
 
647 aa  78.2  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 
634 aa  78.6  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 
635 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 
635 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  26.26 
 
 
635 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  27 
 
 
645 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  32.53 
 
 
635 aa  77.8  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  28.83 
 
 
662 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 
635 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 
635 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 
635 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1577  threonyl-tRNA synthetase  31.06 
 
 
635 aa  77.4  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704052  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0294  threonyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 
637 aa  76.3  0.000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 
644 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 
635 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 
635 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
643 aa  76.3  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 
635 aa  76.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 
644 aa  75.5  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  24.59 
 
 
648 aa  75.1  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0978  threonyl-tRNA synthetase  30.3 
 
 
633 aa  75.1  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
640 aa  75.1  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 
635 aa  75.1  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1373  threonyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 
645 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000340223  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  25.25 
 
 
635 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2859  threonyl-tRNA synthetase  28.66 
 
 
639 aa  75.1  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.248456  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  29.52 
 
 
635 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>