232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3863 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  95.94 
 
 		 714 aa  1242    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3863  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 715 aa  1407    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3780  cyclic nucleotide-binding protein  99.3 
 
 		 715 aa  1397    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12201  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3852  cyclic nucleotide-binding protein  72.45 
 
 		 713 aa  970    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0041  phosphoribulokinase/uridine kinase  38.12 
 
 		 554 aa  361  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.448598  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0332  phosphoribulokinase/uridine kinase  35.74 
 
 		 557 aa  332  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1435  AAA ATPase  34.35 
 
 		 552 aa  330  6e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0178  phosphoribulokinase/uridine kinase  37.03 
 
 		 555 aa  330  6e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.871097  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0176  phosphoribulokinase/uridine kinase  36.65 
 
 		 555 aa  330  7e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0833476  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1290  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.33 
 
 		 547 aa  328  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.297478  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1435  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.51 
 
 		 553 aa  325  3e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2238  phosphoribulokinase/uridine kinase  39.14 
 
 		 567 aa  322  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.958517  normal  0.150287 
 
 
-
 
NC_002950  PG1745  phosphoribulokinase family protein  36.87 
 
 		 529 aa  321  3.9999999999999996e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  32.57 
 
 		 558 aa  320  6e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1101  uridine kinase  37.2 
 
 		 557 aa  319  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3519  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.91 
 
 		 553 aa  317  5e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10770  uridine kinase  33.27 
 
 		 549 aa  313  6.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3162  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.63 
 
 		 552 aa  313  7.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1361  AAA ATPase  38.26 
 
 		 547 aa  312  1e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.762498  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0531  AAA ATPase  34.04 
 
 		 554 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.777332  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1763  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.77 
 
 		 559 aa  306  9.000000000000001e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.295373  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  35.36 
 
 		 555 aa  296  6e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.48 
 
 		 462 aa  295  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2289  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  34.47 
 
 		 550 aa  283  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0142692  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1554  putative threonyl-tRNA synthetase/uridine kinase  32.03 
 
 		 551 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.614355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1347  phosphoribulokinase / uridine kinase family protein  32.68 
 
 		 551 aa  281  3e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5127  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.37 
 
 		 205 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.426663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4546  phosphoribulokinase/uridine kinase  29.41 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  29.51 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3563  uridine kinase  30.77 
 
 		 213 aa  68.6  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.933791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 		 646 aa  68.2  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  25.35 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  32.54 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  29.21 
 
 		 204 aa  65.1  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 		 644 aa  65.1  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2617  uridine kinase  31.84 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1657  uridine kinase  31.84 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0722731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1732  uridine kinase  31.84 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000414727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1762  uridine kinase  31.84 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0067733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 		 637 aa  64.3  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2218  uridine kinase  31.84 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.428302  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  27.23 
 
 		 504 aa  63.5  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  26.34 
 
 		 644 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02924  uridine kinase  30.77 
 
 		 213 aa  62.4  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2054  uridine kinase  31.55 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 		 640 aa  61.2  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2228  uridine kinase  32.16 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2463  uridine kinase  31.28 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000426115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1888  uridine kinase  31.28 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127737  normal  0.0259304 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2576  uridine kinase  31.28 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0976754  normal  0.0423229 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2244  uridine kinase  30.73 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2456  uridine kinase  31.28 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000511378  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  27.56 
 
 		 212 aa  60.1  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  29.65 
 
 		 216 aa  60.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002983  uridine kinase (C1)  30.77 
 
 		 213 aa  60.1  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.163408  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  31.4 
 
 		 649 aa  59.3  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07150  uridine kinase  26.87 
 
 		 202 aa  59.3  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 		 644 aa  59.3  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1575  uridine kinase  31.95 
 
 		 211 aa  58.9  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  29.59 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2005  uridine kinase  26.97 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.679011  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 		 635 aa  58.5  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0556  uridine kinase  30.77 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0365333  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4227  uridine kinase  33.58 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36540  uridine kinase  29.33 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.36252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  30.41 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1385  uridine kinase  28.5 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  29.06 
 
 		 644 aa  57.4  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1197  uridine kinase  30.99 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  27.22 
 
 		 211 aa  57.4  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0537  uridine kinase  29.01 
 
 		 242 aa  56.6  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0563702  hitchhiker  0.00000000000000916272 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  30.59 
 
 		 207 aa  57  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1332  phosphoribulokinase/uridine kinase  29.31 
 
 		 321 aa  56.6  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2651  uridine kinase  31.95 
 
 		 211 aa  56.2  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.212203 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  27.18 
 
 		 648 aa  56.6  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  29.61 
 
 		 212 aa  56.2  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1576  uridine kinase  30.81 
 
 		 213 aa  56.2  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.435743 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  25.15 
 
 		 209 aa  56.6  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1979  uridine kinase  28.89 
 
 		 211 aa  56.2  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  hitchhiker  0.00165825 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  28.4 
 
 		 207 aa  56.2  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  28.4 
 
 		 207 aa  56.2  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  27.21 
 
 		 662 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1919  uridine kinase  35.09 
 
 		 211 aa  56.6  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2871  uridine kinase  30.41 
 
 		 213 aa  55.8  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2453  uridine kinase  30.81 
 
 		 213 aa  55.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3195  uridine kinase  30.81 
 
 		 213 aa  55.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0472319  hitchhiker  0.00149984 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2552  uridine kinase  30.81 
 
 		 213 aa  55.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1289  uridine kinase  29.24 
 
 		 213 aa  55.1  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3042  uridine kinase  29.24 
 
 		 213 aa  54.7  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  29.59 
 
 		 647 aa  54.3  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1422  uridine kinase  30.37 
 
 		 236 aa  54.7  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 		 644 aa  54.3  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2249  uridine kinase  29.82 
 
 		 213 aa  54.3  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2349  uridine kinase  29.82 
 
 		 213 aa  54.3  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0736  uridine kinase  29.66 
 
 		 212 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2463  uridine kinase  29.82 
 
 		 213 aa  54.3  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.92076  normal  0.601786 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2356  uridine kinase  29.82 
 
 		 213 aa  54.3  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0747859  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4500  uridine kinase  31.06 
 
 		 212 aa  54.3  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3886  threonyl-tRNA synthetase  29.03 
 
 		 687 aa  54.3  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 		 636 aa  53.9  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>