More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3852 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3780  cyclic nucleotide-binding protein  71.61 
 
 		 715 aa  945    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12201  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3863  cyclic nucleotide-binding protein  71.75 
 
 		 715 aa  946    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  72.87 
 
 		 714 aa  957    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3852  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 713 aa  1400    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0041  phosphoribulokinase/uridine kinase  38.78 
 
 		 554 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.448598  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0178  phosphoribulokinase/uridine kinase  38.38 
 
 		 555 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.871097  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0176  phosphoribulokinase/uridine kinase  38.38 
 
 		 555 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0833476  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1101  uridine kinase  37.12 
 
 		 557 aa  326  9e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0332  phosphoribulokinase/uridine kinase  36.12 
 
 		 557 aa  325  1e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10770  uridine kinase  36.38 
 
 		 549 aa  325  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2238  phosphoribulokinase/uridine kinase  39.78 
 
 		 567 aa  325  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.958517  normal  0.150287 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1290  phosphoribulokinase/uridine kinase  35.06 
 
 		 547 aa  325  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.297478  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1763  phosphoribulokinase/uridine kinase  36.33 
 
 		 559 aa  323  6e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.295373  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1435  AAA ATPase  33.52 
 
 		 552 aa  319  1e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  35.08 
 
 		 555 aa  318  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3162  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.42 
 
 		 552 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1745  phosphoribulokinase family protein  37.6 
 
 		 529 aa  317  6e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.04 
 
 		 558 aa  317  7e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1361  AAA ATPase  37.85 
 
 		 547 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.762498  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0531  AAA ATPase  32.38 
 
 		 554 aa  306  8.000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.777332  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1435  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.68 
 
 		 553 aa  305  2.0000000000000002e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  40.31 
 
 		 462 aa  293  6e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3519  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.27 
 
 		 553 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1554  putative threonyl-tRNA synthetase/uridine kinase  32.13 
 
 		 551 aa  286  8e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.614355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1347  phosphoribulokinase / uridine kinase family protein  32.61 
 
 		 551 aa  284  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2289  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  34.54 
 
 		 550 aa  281  4e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0142692  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5127  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.23 
 
 		 205 aa  78.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.426663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4546  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.12 
 
 		 217 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  28.92 
 
 		 646 aa  72.4  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 637 aa  67  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3563  uridine kinase  28.5 
 
 		 213 aa  66.2  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.933791  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  27.01 
 
 		 204 aa  66.2  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 640 aa  66.6  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 643 aa  65.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  28.66 
 
 		 638 aa  65.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  27.54 
 
 		 208 aa  63.9  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  30.97 
 
 		 212 aa  63.9  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  28.43 
 
 		 504 aa  62.8  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  28.44 
 
 		 662 aa  62.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  27.59 
 
 		 219 aa  63.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  27.86 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  30.67 
 
 		 639 aa  60.8  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 		 635 aa  60.8  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1448  threonyl-tRNA synthetase  30.67 
 
 		 639 aa  60.8  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02924  uridine kinase  27.4 
 
 		 213 aa  60.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  28.22 
 
 		 638 aa  60.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  28.66 
 
 		 636 aa  60.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  30.67 
 
 		 648 aa  60.1  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 		 636 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07150  uridine kinase  26.5 
 
 		 202 aa  59.3  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  28.4 
 
 		 645 aa  59.7  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  23.38 
 
 		 209 aa  59.7  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 		 635 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  27.43 
 
 		 207 aa  59.3  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 		 635 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  27.43 
 
 		 207 aa  59.3  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 		 635 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  29.34 
 
 		 644 aa  59.3  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  29.34 
 
 		 644 aa  59.3  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 636 aa  59.3  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4227  uridine kinase  33.08 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1197  uridine kinase  29.31 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  28.83 
 
 		 635 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  25.45 
 
 		 635 aa  58.2  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  28.83 
 
 		 635 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 		 641 aa  58.2  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3025  threonyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 		 638 aa  58.2  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3487  threonyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 		 643 aa  57.8  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1493  uridine kinase  29.85 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.54247 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  28.65 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 		 635 aa  57.4  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 		 635 aa  57  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 		 638 aa  56.6  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002983  uridine kinase (C1)  27.05 
 
 		 213 aa  57  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.163408  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2617  uridine kinase  28.29 
 
 		 212 aa  56.6  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  23.64 
 
 		 646 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2871  uridine kinase  28.74 
 
 		 213 aa  57.4  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2680  uridine kinase  28.25 
 
 		 213 aa  57.4  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1010  threonyl-tRNA synthetase  28.22 
 
 		 640 aa  56.6  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  25.13 
 
 		 211 aa  57  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1657  uridine kinase  28.29 
 
 		 212 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0722731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1732  uridine kinase  28.29 
 
 		 212 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000414727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2244  uridine kinase  27.8 
 
 		 212 aa  57  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1762  uridine kinase  28.29 
 
 		 212 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0067733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1385  uridine kinase  28.22 
 
 		 209 aa  57  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 		 641 aa  57  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  30.06 
 
 		 635 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  29.5 
 
 		 207 aa  56.2  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  36.26 
 
 		 160 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  28.22 
 
 		 635 aa  56.2  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  30.06 
 
 		 669 aa  56.6  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2054  uridine kinase  29.94 
 
 		 212 aa  56.6  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 		 644 aa  56.6  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2218  uridine kinase  28.29 
 
 		 212 aa  56.2  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.428302  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1888  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 		 635 aa  55.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150098 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 		 637 aa  55.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2463  uridine kinase  29.27 
 
 		 212 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000426115  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  27.61 
 
 		 640 aa  55.8  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 		 647 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0556  uridine kinase  26.67 
 
 		 219 aa  55.1  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0365333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>