More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1435 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0332  phosphoribulokinase/uridine kinase  59.96 
 
 		 557 aa  694    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1435  AAA ATPase  100 
 
 		 552 aa  1129    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1101  uridine kinase  49.53 
 
 		 557 aa  545  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0531  AAA ATPase  50.46 
 
 		 554 aa  542  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.777332  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0041  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.87 
 
 		 554 aa  544  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.448598  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10770  uridine kinase  48.82 
 
 		 549 aa  540  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1290  phosphoribulokinase/uridine kinase  49.17 
 
 		 547 aa  536  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.297478  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0176  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.95 
 
 		 555 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0833476  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  48.28 
 
 		 558 aa  517  1.0000000000000001e-145  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0178  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.77 
 
 		 555 aa  514  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.871097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3162  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.98 
 
 		 552 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3519  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.06 
 
 		 553 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1435  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.56 
 
 		 553 aa  490  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1745  phosphoribulokinase family protein  45.12 
 
 		 529 aa  480  1e-134  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1554  putative threonyl-tRNA synthetase/uridine kinase  47.45 
 
 		 551 aa  479  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.614355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1347  phosphoribulokinase / uridine kinase family protein  45.99 
 
 		 551 aa  478  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1763  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.61 
 
 		 559 aa  475  1e-133  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.295373  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2238  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.97 
 
 		 567 aa  458  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.958517  normal  0.150287 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1361  AAA ATPase  42.91 
 
 		 547 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.762498  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.28 
 
 		 555 aa  444  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2289  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  40.7 
 
 		 550 aa  424  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  42.15 
 
 		 462 aa  386  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.81 
 
 		 714 aa  306  7e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3852  cyclic nucleotide-binding protein  33.52 
 
 		 713 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3863  cyclic nucleotide-binding protein  33.78 
 
 		 715 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3780  cyclic nucleotide-binding protein  33.78 
 
 		 715 aa  296  7e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12201  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 		 638 aa  98.2  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 		 637 aa  96.3  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 638 aa  95.1  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 		 639 aa  94.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 		 662 aa  91.3  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 		 640 aa  90.1  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 639 aa  90.1  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 		 635 aa  90.1  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  29.81 
 
 		 644 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 642 aa  89.4  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 634 aa  88.2  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 		 646 aa  88.2  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  23.12 
 
 		 645 aa  87  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1448  threonyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 		 639 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 		 648 aa  85.5  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  25.79 
 
 		 638 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 		 639 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  24.86 
 
 		 633 aa  84.7  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  26.29 
 
 		 649 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  25.67 
 
 		 643 aa  84  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2095  threonyl-tRNA synthetase  34.96 
 
 		 684 aa  82.8  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00031634  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 		 641 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02079  threonyl-tRNA synthetase  26.63 
 
 		 642 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  25.67 
 
 		 644 aa  82.4  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  25.67 
 
 		 644 aa  82.4  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  26 
 
 		 647 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  24.04 
 
 		 636 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  23.35 
 
 		 636 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  23.35 
 
 		 636 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  25.41 
 
 		 635 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  26.63 
 
 		 646 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  24.61 
 
 		 641 aa  80.9  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  25.41 
 
 		 635 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  25.41 
 
 		 633 aa  80.5  0.00000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2263  threonyl-tRNA synthetase  24.61 
 
 		 642 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 		 638 aa  80.1  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2018  threonyl-tRNA synthetase  25.65 
 
 		 642 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000164437  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  26.53 
 
 		 644 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  25.87 
 
 		 640 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1951  threonyl-tRNA synthetase  26.8 
 
 		 642 aa  79.7  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250897  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  24.86 
 
 		 646 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  24.86 
 
 		 635 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  24.86 
 
 		 635 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  26.49 
 
 		 645 aa  79.7  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  25.41 
 
 		 648 aa  80.1  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  24.86 
 
 		 635 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 		 635 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 640 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1800  threonyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 		 642 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000021107  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2299  threonyl-tRNA synthetase  26.18 
 
 		 642 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 639 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1913  threonyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 		 642 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.121147  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1937  threonyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 		 642 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227542  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2180  threonyl-tRNA synthetase  27.65 
 
 		 642 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0516058  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  24.86 
 
 		 635 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 640 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  23.12 
 
 		 636 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003716  threonyl-tRNA synthetase  25.63 
 
 		 642 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000263633  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  30.38 
 
 		 641 aa  79  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  25.27 
 
 		 653 aa  78.6  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  24.32 
 
 		 635 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2330  threonyl-tRNA synthetase  25.13 
 
 		 642 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0271546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2184  threonyl-tRNA synthetase  25.13 
 
 		 642 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00110297  normal  0.0619303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6132  threonyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 659 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158599  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2148  threonyl-tRNA synthetase  25.13 
 
 		 642 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00500642  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0844  threonyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 642 aa  78.2  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 		 639 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2222  threonyl-tRNA synthetase  25.13 
 
 		 642 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000682535  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 640 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 639 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1961  threonyl-tRNA synthetase  28.4 
 
 		 642 aa  78.2  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000224309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 639 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2043  threonyl-tRNA synthetase  25.65 
 
 		 642 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000275607  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 639 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>