More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0031 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  100 
 
 		 555 aa  1119    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0332  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.76 
 
 		 557 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1290  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.6 
 
 		 547 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.297478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10770  uridine kinase  46.11 
 
 		 549 aa  461  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1101  uridine kinase  45.28 
 
 		 557 aa  455  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0041  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.79 
 
 		 554 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.448598  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0531  AAA ATPase  46.98 
 
 		 554 aa  442  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.777332  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1435  AAA ATPase  41.28 
 
 		 552 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.21 
 
 		 558 aa  430  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1763  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.64 
 
 		 559 aa  426  1e-118  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.295373  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0178  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.91 
 
 		 555 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.871097  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0176  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.91 
 
 		 555 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0833476  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1435  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.3 
 
 		 553 aa  412  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1554  putative threonyl-tRNA synthetase/uridine kinase  44.61 
 
 		 551 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.614355  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1361  AAA ATPase  38.63 
 
 		 547 aa  405  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.762498  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1347  phosphoribulokinase / uridine kinase family protein  45.09 
 
 		 551 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2238  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.02 
 
 		 567 aa  391  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.958517  normal  0.150287 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3519  phosphoribulokinase/uridine kinase  40.73 
 
 		 553 aa  392  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3162  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.11 
 
 		 552 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1745  phosphoribulokinase family protein  40.86 
 
 		 529 aa  377  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2289  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  39.3 
 
 		 550 aa  368  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  39.75 
 
 		 462 aa  331  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3852  cyclic nucleotide-binding protein  35.08 
 
 		 713 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.33 
 
 		 714 aa  269  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3780  cyclic nucleotide-binding protein  35.33 
 
 		 715 aa  267  4e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12201  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3863  cyclic nucleotide-binding protein  35.33 
 
 		 715 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  33.54 
 
 		 641 aa  89.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  32.12 
 
 		 644 aa  89  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  32.12 
 
 		 644 aa  89  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  31.06 
 
 		 636 aa  87.4  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  32 
 
 		 644 aa  87.4  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 638 aa  86.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1870  threonyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 		 635 aa  86.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47552  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 		 644 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2859  threonyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 		 639 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.248456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01383  threonyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 		 649 aa  84  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2098  threonyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 		 644 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000824061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2417  threonyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 		 644 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00010604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2805  threonyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 633 aa  83.2  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 		 635 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20420  threonyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 640 aa  80.5  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3481  threonyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 		 640 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800828  normal  0.0249513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2465  threonyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 		 640 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3225  threonyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 		 640 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.529889 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  31 
 
 		 635 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  29.8 
 
 		 635 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  29.8 
 
 		 635 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  29.8 
 
 		 635 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  30.5 
 
 		 635 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  30.3 
 
 		 635 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  29.8 
 
 		 635 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  29.8 
 
 		 635 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  29.8 
 
 		 635 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  31 
 
 		 635 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  29.8 
 
 		 635 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  29.8 
 
 		 635 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  28.93 
 
 		 638 aa  78.6  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 		 643 aa  78.6  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 		 640 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 		 640 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 635 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 635 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 635 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  29.5 
 
 		 635 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  29.29 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1967  threonyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 		 640 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134711  normal  0.0132251 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  29.19 
 
 		 636 aa  77  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  29.81 
 
 		 636 aa  77  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  29 
 
 		 635 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 		 635 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  30.1 
 
 		 639 aa  76.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1422  uridine kinase  28.44 
 
 		 236 aa  75.5  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  31.06 
 
 		 643 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1478  threonyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 660 aa  76.3  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000148351  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  29 
 
 		 635 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1415  threonyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 		 660 aa  75.9  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000939714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 636 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4546  phosphoribulokinase/uridine kinase  30.69 
 
 		 217 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 640 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3025  threonyl-tRNA synthetase  28.79 
 
 		 638 aa  75.1  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2020  threonyl-tRNA synthetase  27.88 
 
 		 635 aa  74.7  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2099  threonyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 		 635 aa  74.7  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  29.81 
 
 		 638 aa  74.7  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  27.95 
 
 		 645 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  27.55 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 640 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1365  uridine kinase  29.24 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.759935  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0453  uridine kinase  28.33 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00211906  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  31.06 
 
 		 635 aa  73.9  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2499  threonyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 		 638 aa  73.9  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0219257  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  28.71 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 		 635 aa  73.6  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  26.63 
 
 		 504 aa  73.6  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  25.82 
 
 		 641 aa  73.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  28.83 
 
 		 211 aa  72.8  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1931  threonyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 		 640 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3487  threonyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 643 aa  72.4  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  27.8 
 
 		 635 aa  72.4  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 640 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1320  threonyl-tRNA synthetase  26.34 
 
 		 637 aa  72  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.865645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>