More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1554 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1554  putative threonyl-tRNA synthetase/uridine kinase  100 
 
 		 551 aa  1110    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.614355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1347  phosphoribulokinase / uridine kinase family protein  97.46 
 
 		 551 aa  1058    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0332  phosphoribulokinase/uridine kinase  49.42 
 
 		 557 aa  488  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3519  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.46 
 
 		 553 aa  488  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1290  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.53 
 
 		 547 aa  478  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.297478  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1435  AAA ATPase  47.45 
 
 		 552 aa  478  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3162  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.11 
 
 		 552 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0041  phosphoribulokinase/uridine kinase  43.78 
 
 		 554 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.448598  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0531  AAA ATPase  47.88 
 
 		 554 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.777332  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10770  uridine kinase  48.3 
 
 		 549 aa  464  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.6 
 
 		 558 aa  447  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1101  uridine kinase  44.24 
 
 		 557 aa  448  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1763  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.56 
 
 		 559 aa  434  1e-120  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.295373  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0176  phosphoribulokinase/uridine kinase  43.84 
 
 		 555 aa  426  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0833476  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0178  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.02 
 
 		 555 aa  428  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.871097  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.42 
 
 		 555 aa  420  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1361  AAA ATPase  40.58 
 
 		 547 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.762498  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1435  phosphoribulokinase/uridine kinase  42.54 
 
 		 553 aa  414  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1745  phosphoribulokinase family protein  42.63 
 
 		 529 aa  405  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2238  phosphoribulokinase/uridine kinase  39.3 
 
 		 567 aa  405  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.958517  normal  0.150287 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2289  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  38.52 
 
 		 550 aa  359  6e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  42.05 
 
 		 462 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3852  cyclic nucleotide-binding protein  32.13 
 
 		 713 aa  274  3e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.19 
 
 		 714 aa  260  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3863  cyclic nucleotide-binding protein  31.83 
 
 		 715 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3780  cyclic nucleotide-binding protein  31.83 
 
 		 715 aa  257  4e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12201  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1373  threonyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 		 645 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000340223  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 638 aa  73.6  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  26.8 
 
 		 643 aa  70.9  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 		 635 aa  70.1  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 		 638 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  28.86 
 
 		 635 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  28 
 
 		 638 aa  68.9  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  28.49 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  27.86 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 640 aa  67  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  26.74 
 
 		 640 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  25.32 
 
 		 662 aa  66.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  21.99 
 
 		 639 aa  65.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  27.43 
 
 		 212 aa  65.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  28.48 
 
 		 635 aa  65.1  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  28.41 
 
 		 204 aa  65.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  26.44 
 
 		 638 aa  65.1  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  27.5 
 
 		 640 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  26.38 
 
 		 639 aa  65.1  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  26.38 
 
 		 639 aa  64.7  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  26.38 
 
 		 639 aa  65.1  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  26.14 
 
 		 633 aa  65.1  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  26.38 
 
 		 639 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  27.17 
 
 		 640 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  27.56 
 
 		 646 aa  64.3  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  29.05 
 
 		 643 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0978  threonyl-tRNA synthetase  26.14 
 
 		 633 aa  63.9  0.000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  27.27 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 645 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 645 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 645 aa  63.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  26.51 
 
 		 639 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 645 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 		 639 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 645 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 645 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 645 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  26.57 
 
 		 631 aa  63.5  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  24.84 
 
 		 659 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 645 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  26.63 
 
 		 640 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  26.61 
 
 		 504 aa  62.4  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  28.29 
 
 		 657 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  30.38 
 
 		 645 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  30.38 
 
 		 645 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2617  uridine kinase  26.74 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1657  uridine kinase  26.74 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0722731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1732  uridine kinase  26.74 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000414727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1762  uridine kinase  26.74 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0067733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1493  uridine kinase  25.12 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.54247 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  27.12 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 640 aa  60.1  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  24.2 
 
 		 638 aa  59.7  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1385  uridine kinase  27.62 
 
 		 209 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  25.79 
 
 		 636 aa  59.7  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  26.85 
 
 		 635 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  25.25 
 
 		 209 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  28.19 
 
 		 647 aa  58.9  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 		 643 aa  58.9  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  26.11 
 
 		 211 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 		 635 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2218  uridine kinase  26.2 
 
 		 212 aa  58.9  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.428302  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4616  threonyl-tRNA synthetase  26.85 
 
 		 643 aa  59.3  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213357 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  23.59 
 
 		 644 aa  59.7  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  23.18 
 
 		 636 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1478  threonyl-tRNA synthetase  25.68 
 
 		 660 aa  58.9  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000148351  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1575  uridine kinase  25.81 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1415  threonyl-tRNA synthetase  25.68 
 
 		 660 aa  58.5  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000939714  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  26.28 
 
 		 641 aa  58.9  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  27.21 
 
 		 633 aa  58.2  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0422  uridine kinase  26.82 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.174111  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 639 aa  58.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02924  uridine kinase  25.65 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3931  phosphoribulokinase  27.27 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>