163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3054 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  100 
 
 		 462 aa  948    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10770  uridine kinase  44.65 
 
 		 549 aa  398  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0332  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.32 
 
 		 557 aa  398  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0041  phosphoribulokinase/uridine kinase  45 
 
 		 554 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.448598  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.21 
 
 		 558 aa  395  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1290  phosphoribulokinase/uridine kinase  43.71 
 
 		 547 aa  393  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.297478  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1435  AAA ATPase  41.74 
 
 		 552 aa  386  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1101  uridine kinase  43.48 
 
 		 557 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1745  phosphoribulokinase family protein  40.74 
 
 		 529 aa  365  1e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0178  phosphoribulokinase/uridine kinase  43.42 
 
 		 555 aa  361  1e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.871097  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0176  phosphoribulokinase/uridine kinase  43.42 
 
 		 555 aa  362  1e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0833476  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3519  phosphoribulokinase/uridine kinase  40.45 
 
 		 553 aa  359  7e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0531  AAA ATPase  41.94 
 
 		 554 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.777332  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1361  AAA ATPase  41.93 
 
 		 547 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.762498  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1347  phosphoribulokinase / uridine kinase family protein  41 
 
 		 551 aa  354  2e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1554  putative threonyl-tRNA synthetase/uridine kinase  41 
 
 		 551 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.614355  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1763  phosphoribulokinase/uridine kinase  39.92 
 
 		 559 aa  353  4e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.295373  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3162  phosphoribulokinase/uridine kinase  40.66 
 
 		 552 aa  350  4e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1435  phosphoribulokinase/uridine kinase  40.04 
 
 		 553 aa  334  2e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2238  phosphoribulokinase/uridine kinase  39.79 
 
 		 567 aa  333  5e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.958517  normal  0.150287 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  39.75 
 
 		 555 aa  331  1e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2289  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  36.49 
 
 		 550 aa  279  7e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3852  cyclic nucleotide-binding protein  40.31 
 
 		 713 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3863  cyclic nucleotide-binding protein  44.48 
 
 		 715 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3780  cyclic nucleotide-binding protein  46.01 
 
 		 715 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12201  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  45.69 
 
 		 714 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  30.69 
 
 		 208 aa  85.1  0.000000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1385  uridine kinase  32.66 
 
 		 209 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  31.82 
 
 		 204 aa  83.2  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  29.29 
 
 		 211 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  31.67 
 
 		 219 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  31.07 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3563  uridine kinase  32 
 
 		 213 aa  76.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.933791  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  28.86 
 
 		 219 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1781  uridine kinase  29.17 
 
 		 209 aa  75.5  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  30.69 
 
 		 207 aa  75.1  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2356  uridine kinase  28.71 
 
 		 213 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0747859  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2463  uridine kinase  28.71 
 
 		 213 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.92076  normal  0.601786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2249  uridine kinase  28.71 
 
 		 213 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2349  uridine kinase  28.71 
 
 		 213 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  29.85 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07150  uridine kinase  30.15 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  28.34 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  28.34 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  29.76 
 
 		 504 aa  73.9  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1740  uridine kinase  30.69 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.627897  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2023  uridine kinase  29.79 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2305  uridine kinase  28.23 
 
 		 213 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0453  uridine kinase  32.14 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00211906  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01972  uridine kinase  27.75 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1591  uridine kinase  27.75 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4546  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.16 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3003  uridine kinase  27.75 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01961  hypothetical protein  27.75 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2206  uridine kinase  27.75 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2359  uridine kinase  27.75 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1576  uridine kinase  28.64 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.435743 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1575  uridine kinase  27.75 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0994  uridine kinase  27.75 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1166  uridine kinase  27.75 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2617  uridine kinase  28.64 
 
 		 212 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1657  uridine kinase  28.64 
 
 		 212 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0722731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1732  uridine kinase  28.64 
 
 		 212 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000414727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1762  uridine kinase  28.64 
 
 		 212 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0067733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5127  phosphoribulokinase/uridine kinase  26.83 
 
 		 205 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.426663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2463  uridine kinase  28.64 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000426115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2453  uridine kinase  27.64 
 
 		 213 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  24.55 
 
 		 209 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3195  uridine kinase  27.64 
 
 		 213 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0472319  hitchhiker  0.00149984 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2552  uridine kinase  27.64 
 
 		 213 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1175  uridine kinase  28.34 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1422  uridine kinase  26.74 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0537  uridine kinase  27.51 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0563702  hitchhiker  0.00000000000000916272 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0736  uridine kinase  27.81 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3042  uridine kinase  26.79 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1888  uridine kinase  28.64 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127737  normal  0.0259304 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  27.5 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1575  uridine kinase  28 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2680  uridine kinase  27.5 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2871  uridine kinase  28.23 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2456  uridine kinase  28.64 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000511378  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2651  uridine kinase  29 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.212203 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2576  uridine kinase  28.64 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0976754  normal  0.0423229 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4500  uridine kinase  27.81 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  28.22 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1289  uridine kinase  26.79 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  26.61 
 
 		 211 aa  67  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2218  uridine kinase  28.14 
 
 		 212 aa  67  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.428302  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4462  uridine kinase  27.22 
 
 		 212 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0409991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4513  uridine kinase  27.22 
 
 		 212 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295414  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1365  uridine kinase  30.34 
 
 		 204 aa  67  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.759935  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3093  uridine kinase  27.13 
 
 		 212 aa  67  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  24.88 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2228  uridine kinase  26.7 
 
 		 215 aa  66.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1197  uridine kinase  28.23 
 
 		 213 aa  65.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1979  uridine kinase  28.64 
 
 		 211 aa  66.6  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  hitchhiker  0.00165825 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4113  uridine kinase  26.63 
 
 		 212 aa  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4124  uridine kinase  26.63 
 
 		 212 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4460  uridine kinase  26.63 
 
 		 212 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0770159 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0556  uridine kinase  27.35 
 
 		 219 aa  65.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0365333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>