More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0332 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0332  phosphoribulokinase/uridine kinase  100 
 
 		 557 aa  1139    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1435  AAA ATPase  59.96 
 
 		 552 aa  686    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10770  uridine kinase  54.95 
 
 		 549 aa  587  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0531  AAA ATPase  55.43 
 
 		 554 aa  585  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.777332  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1290  phosphoribulokinase/uridine kinase  54.75 
 
 		 547 aa  588  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.297478  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1101  uridine kinase  53.08 
 
 		 557 aa  574  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0176  phosphoribulokinase/uridine kinase  53.93 
 
 		 555 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0833476  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0178  phosphoribulokinase/uridine kinase  54.36 
 
 		 555 aa  561  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.871097  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0041  phosphoribulokinase/uridine kinase  49.36 
 
 		 554 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.448598  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3162  phosphoribulokinase/uridine kinase  50.93 
 
 		 552 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3519  phosphoribulokinase/uridine kinase  48.1 
 
 		 553 aa  537  1e-151  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  50 
 
 		 558 aa  530  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1435  phosphoribulokinase/uridine kinase  51.06 
 
 		 553 aa  521  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1763  phosphoribulokinase/uridine kinase  52.21 
 
 		 559 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.295373  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1745  phosphoribulokinase family protein  46.32 
 
 		 529 aa  489  1e-137  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1554  putative threonyl-tRNA synthetase/uridine kinase  49.42 
 
 		 551 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.614355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1347  phosphoribulokinase / uridine kinase family protein  49.62 
 
 		 551 aa  491  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1361  AAA ATPase  46.21 
 
 		 547 aa  484  1e-135  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.762498  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.76 
 
 		 555 aa  480  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2238  phosphoribulokinase/uridine kinase  43.07 
 
 		 567 aa  474  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.958517  normal  0.150287 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2289  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  41.17 
 
 		 550 aa  428  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.32 
 
 		 462 aa  411  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3852  cyclic nucleotide-binding protein  36.12 
 
 		 713 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.99 
 
 		 714 aa  312  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3863  cyclic nucleotide-binding protein  34.8 
 
 		 715 aa  310  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3780  cyclic nucleotide-binding protein  34.67 
 
 		 715 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12201  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 		 637 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  31.28 
 
 		 636 aa  108  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  28.87 
 
 		 645 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  29.56 
 
 		 662 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1448  threonyl-tRNA synthetase  29.15 
 
 		 639 aa  101  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 		 639 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  29.15 
 
 		 639 aa  101  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  32.18 
 
 		 640 aa  101  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  30.96 
 
 		 635 aa  100  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  30.26 
 
 		 645 aa  99  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  30.26 
 
 		 644 aa  97.4  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  30.5 
 
 		 640 aa  97.1  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 		 639 aa  97.1  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 		 639 aa  96.7  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  30.1 
 
 		 634 aa  96.7  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 		 639 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 		 638 aa  96.7  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 		 639 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  29.65 
 
 		 639 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 		 639 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 		 639 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2859  threonyl-tRNA synthetase  29.44 
 
 		 639 aa  96.3  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.248456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 		 646 aa  96.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  30.85 
 
 		 640 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  28.93 
 
 		 635 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  30.15 
 
 		 635 aa  95.5  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  26.77 
 
 		 636 aa  95.5  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  28 
 
 		 640 aa  95.1  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  29.44 
 
 		 635 aa  95.1  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  29.44 
 
 		 635 aa  95.1  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 636 aa  94.7  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 		 636 aa  94.4  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1870  threonyl-tRNA synthetase  29.44 
 
 		 635 aa  94  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47552  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 		 635 aa  94  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 		 635 aa  94  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 		 635 aa  94  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  29.35 
 
 		 638 aa  93.6  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  29.02 
 
 		 647 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  28.06 
 
 		 633 aa  92.8  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 		 635 aa  93.2  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 		 635 aa  93.2  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  29.67 
 
 		 635 aa  92.8  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4616  threonyl-tRNA synthetase  29.56 
 
 		 643 aa  92.8  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3089  threonyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 		 639 aa  92.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.345995  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 635 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 635 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 		 635 aa  91.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 633 aa  91.3  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 		 643 aa  91.3  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0844  threonyl-tRNA synthetase  29.15 
 
 		 642 aa  90.9  6e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 646 aa  90.9  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 		 635 aa  90.5  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 644 aa  90.1  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 635 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 635 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 635 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 635 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  28 
 
 		 644 aa  89  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  28 
 
 		 644 aa  89  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 635 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1638  threonyl-tRNA synthetase  25.79 
 
 		 660 aa  89  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.360122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 635 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 635 aa  89  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 635 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  27.14 
 
 		 669 aa  88.6  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  26.9 
 
 		 638 aa  88.2  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1415  threonyl-tRNA synthetase  25.38 
 
 		 660 aa  88.2  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000939714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1478  threonyl-tRNA synthetase  24.75 
 
 		 660 aa  87.8  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000148351  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0641  threonyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 658 aa  87.8  5e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  25.76 
 
 		 641 aa  87.4  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3025  threonyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 638 aa  87.4  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  26.63 
 
 		 635 aa  87.4  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  28.93 
 
 		 641 aa  87  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1071  threonyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 658 aa  86.7  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>