More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0294 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3481  threonyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 
640 aa  678    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800828  normal  0.0249513 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 
635 aa  678    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 
640 aa  678    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5204  threonyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 
688 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.144339 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2465  threonyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 
640 aa  677    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0717195  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  52.67 
 
 
641 aa  691    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1967  threonyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 
640 aa  680    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134711  normal  0.0132251 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1478  threonyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 
660 aa  655    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000148351  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 
638 aa  693    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0978  threonyl-tRNA synthetase  59.45 
 
 
633 aa  802    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1577  threonyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
635 aa  678    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704052  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3225  threonyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 
640 aa  677    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.529889 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06531  threonyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 
638 aa  649    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.218915  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2321  threonyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 
675 aa  659    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.313721 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 
635 aa  661    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06621  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
638 aa  654    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.296705  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1071  threonyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 
658 aa  645    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 
635 aa  671    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 
640 aa  677    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0777  threonyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
654 aa  682    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.795013  normal  0.073481 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1888  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
635 aa  652    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0150098 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2196  threonyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 
640 aa  680    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.163846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18621  threonyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 
640 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1035  threonyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 
693 aa  642    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.233676  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2597  threonyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 
645 aa  635    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000186587  hitchhiker  0.000386738 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 
635 aa  682    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 
637 aa  674    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  51.39 
 
 
637 aa  673    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 
640 aa  678    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2098  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
644 aa  668    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000824061  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  49.52 
 
 
638 aa  662    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0033  threonyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 
641 aa  660    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.611945  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 
635 aa  686    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0934  threonyl-tRNA synthetase  58.58 
 
 
633 aa  769    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.026136  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1007  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 
637 aa  664    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.245371  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  50.89 
 
 
635 aa  677    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2039  threonyl-tRNA synthetase  50.97 
 
 
646 aa  671    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 
635 aa  682    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2154  threonyl-tRNA synthetase  50.57 
 
 
661 aa  649    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1931  threonyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 
640 aa  665    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0165537  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0385  threonyl-tRNA synthetase  50.97 
 
 
646 aa  671    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.752042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 
635 aa  682    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 
635 aa  682    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 
635 aa  682    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10531  threonyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 
638 aa  688    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.487806  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
639 aa  644    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 
635 aa  675    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 
635 aa  682    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 
642 aa  650    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2263  threonyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 
642 aa  636    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 
635 aa  682    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06231  threonyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 
638 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0597  threonyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
638 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.56327  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 
638 aa  696    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3487  threonyl-tRNA synthetase  56.89 
 
 
643 aa  790    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1724  threonyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
642 aa  637    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0116827  normal  0.392039 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 
635 aa  680    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 
635 aa  682    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2168  threonyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 
661 aa  637    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.762302  normal  0.0294607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  52 
 
 
640 aa  680    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0294  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
637 aa  1321    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0006  threonyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 
633 aa  749    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.999215  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1098  threonyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 
648 aa  644    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00129909  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 
669 aa  652    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 
636 aa  714    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1924  threonyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
675 aa  653    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0331233 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 
635 aa  685    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
635 aa  649    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 
635 aa  682    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2668  threonyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 
652 aa  711    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.107403  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4525  threonyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 
659 aa  647    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.082511 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02079  threonyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 
642 aa  638    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1415  threonyl-tRNA synthetase  50.57 
 
 
660 aa  654    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000939714  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2417  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 
644 aa  667    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00010604  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 
635 aa  695    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 
635 aa  679    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1010  threonyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 
640 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2219  threonyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 
635 aa  664    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00166056  normal  0.0562711 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1721  threonyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
648 aa  648    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 
644 aa  670    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  51.05 
 
 
635 aa  680    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06531  threonyl-tRNA synthetase  51.25 
 
 
640 aa  671    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2499  threonyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 
638 aa  652    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0219257  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1007  threonyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 
656 aa  637    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585418  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1638  threonyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 
660 aa  642    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.360122  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6323  threonyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
670 aa  647    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0103626 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1745  threonyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 
637 aa  666    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239329 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  53.22 
 
 
641 aa  682    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4616  threonyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 
643 aa  641    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213357 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 
640 aa  681    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 
644 aa  687    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 
635 aa  677    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 
640 aa  682    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0641  threonyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 
658 aa  645    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  51.05 
 
 
635 aa  680    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 
635 aa  682    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 
640 aa  653    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2368  threonyl-tRNA synthetase  51.06 
 
 
644 aa  662    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.642893  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0955  threonyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 
648 aa  647    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.843203  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0851  threonyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 
646 aa  672    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>