More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1098 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 		 635 aa  673    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3481  threonyl-tRNA synthetase  50.95 
 
 		 640 aa  675    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800828  normal  0.0249513 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 635 aa  684    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2196  threonyl-tRNA synthetase  56.21 
 
 		 640 aa  751    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.163846  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2465  threonyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 		 640 aa  679    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0641  threonyl-tRNA synthetase  53.46 
 
 		 658 aa  751    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2597  threonyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 		 645 aa  645    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000186587  hitchhiker  0.000386738 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 		 638 aa  678    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0978  threonyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 633 aa  674    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1577  threonyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 		 635 aa  677    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0851  threonyl-tRNA synthetase  76.59 
 
 		 646 aa  1049    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4616  threonyl-tRNA synthetase  50.69 
 
 		 643 aa  667    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 640 aa  683    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0955  threonyl-tRNA synthetase  74.85 
 
 		 648 aa  1008    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.843203  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_004310  BR1071  threonyl-tRNA synthetase  55.93 
 
 		 658 aa  752    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4525  threonyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 		 659 aa  702    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.082511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 640 aa  684    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1478  threonyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 660 aa  649    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000148351  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 640 aa  665    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1035  threonyl-tRNA synthetase  55.93 
 
 		 693 aa  750    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.233676  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3089  threonyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 		 639 aa  643    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.345995  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1924  threonyl-tRNA synthetase  57.38 
 
 		 675 aa  757    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0331233 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06531  threonyl-tRNA synthetase  50.49 
 
 		 640 aa  663    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 635 aa  684    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 637 aa  652    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 637 aa  652    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 640 aa  686    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2098  threonyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 		 644 aa  680    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000824061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  50.39 
 
 		 638 aa  652    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0033  threonyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 		 641 aa  650    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.611945  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 635 aa  696    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0934  threonyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 633 aa  658    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.026136  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1007  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 637 aa  674    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.245371  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2035  threonyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 686 aa  741    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 635 aa  684    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2668  threonyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 		 652 aa  754    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.107403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 635 aa  684    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 644 aa  671    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1931  threonyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 640 aa  675    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0385  threonyl-tRNA synthetase  75.5 
 
 		 646 aa  1037    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.752042  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2321  threonyl-tRNA synthetase  55.96 
 
 		 675 aa  747    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.313721 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 635 aa  678    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 		 641 aa  667    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18621  threonyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 		 640 aa  673    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  51.25 
 
 		 639 aa  669    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1888  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 635 aa  669    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5204  threonyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 688 aa  752    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144339 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2746  threonyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 		 690 aa  725    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 642 aa  645    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0942  threonyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 642 aa  641    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484442  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02079  threonyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 642 aa  649    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1415  threonyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 660 aa  648    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000939714  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2859  threonyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 639 aa  659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.248456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 638 aa  663    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3487  threonyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 		 643 aa  801    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0777  threonyl-tRNA synthetase  79.78 
 
 		 654 aa  1099    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.795013  normal  0.073481 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  51.5 
 
 		 635 aa  684    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2039  threonyl-tRNA synthetase  75.35 
 
 		 646 aa  1035    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2168  threonyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 		 661 aa  746    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.762302  normal  0.0294607 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0204  threonyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 664 aa  691    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0294  threonyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 		 637 aa  641    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0006  threonyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 633 aa  653    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.999215  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1098  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 648 aa  1346    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00129909  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 		 669 aa  685    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 		 636 aa  706    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3121  threonyl-tRNA synthetase  54.89 
 
 		 679 aa  727    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 		 635 aa  674    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  52.55 
 
 		 635 aa  678    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 		 635 aa  675    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2154  threonyl-tRNA synthetase  55.32 
 
 		 661 aa  751    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3261  threonyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 		 687 aa  739    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.565813  normal  0.0408031 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1967  threonyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 		 640 aa  677    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134711  normal  0.0132251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1669  threonyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 		 681 aa  737    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115883  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2417  threonyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 644 aa  678    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00010604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 635 aa  701    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 635 aa  684    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 635 aa  674    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 635 aa  684    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1721  threonyl-tRNA synthetase  76.97 
 
 		 648 aa  1062    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0692  threonyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 667 aa  674    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.86772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 		 635 aa  676    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2499  threonyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 		 638 aa  649    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0219257  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1007  threonyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 		 656 aa  765    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585418  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  50.78 
 
 		 635 aa  684    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1054  threonyl-tRNA synthetase  54.14 
 
 		 660 aa  739    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290687  normal  0.56724 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2219  threonyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 		 635 aa  636    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00166056  normal  0.0562711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1745  threonyl-tRNA synthetase  51.56 
 
 		 637 aa  667    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6323  threonyl-tRNA synthetase  57.23 
 
 		 670 aa  757    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103626 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 		 641 aa  676    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1638  threonyl-tRNA synthetase  56.99 
 
 		 660 aa  758    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.360122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 640 aa  681    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  59.35 
 
 		 644 aa  795    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 635 aa  678    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 640 aa  685    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 		 640 aa  670    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 		 635 aa  676    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 635 aa  684    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10531  threonyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 		 638 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.487806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1010  threonyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 640 aa  656    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3225  threonyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 		 640 aa  676    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.529889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>