More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2746 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 		 635 aa  711    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2196  threonyl-tRNA synthetase  60.61 
 
 		 640 aa  793    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.163846  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2465  threonyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 		 640 aa  682    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  54.52 
 
 		 635 aa  723    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2746  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 690 aa  1407    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3089  threonyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 639 aa  663    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.345995  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 638 aa  695    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0978  threonyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 633 aa  692    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1577  threonyl-tRNA synthetase  54.52 
 
 		 635 aa  699    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  54.52 
 
 		 635 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6323  threonyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 670 aa  705    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103626 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10531  threonyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 638 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.487806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06531  threonyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 640 aa  640    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1071  threonyl-tRNA synthetase  55.79 
 
 		 658 aa  741    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  53.75 
 
 		 635 aa  716    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 640 aa  662    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3481  threonyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 640 aa  679    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800828  normal  0.0249513 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2039  threonyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 646 aa  723    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  53.75 
 
 		 635 aa  716    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1054  threonyl-tRNA synthetase  53.95 
 
 		 660 aa  734    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290687  normal  0.56724 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0851  threonyl-tRNA synthetase  53.87 
 
 		 646 aa  728    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  54.52 
 
 		 635 aa  723    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  54.52 
 
 		 635 aa  723    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  52.06 
 
 		 637 aa  670    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 637 aa  669    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 640 aa  663    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2098  threonyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 		 644 aa  661    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000824061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  52.21 
 
 		 638 aa  671    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0033  threonyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 641 aa  637    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.611945  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  53.95 
 
 		 635 aa  721    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0934  threonyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 		 633 aa  675    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.026136  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1007  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  55.32 
 
 		 637 aa  685    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.245371  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2035  threonyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 686 aa  730    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0641  threonyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 		 658 aa  721    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 635 aa  704    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  54.52 
 
 		 635 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1745  threonyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 637 aa  669    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239329 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1931  threonyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 		 640 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0385  threonyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 646 aa  724    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.752042  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1478  threonyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 		 660 aa  653    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000148351  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  53.29 
 
 		 635 aa  714    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4616  threonyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 		 643 aa  684    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213357 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2219  threonyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 		 635 aa  652    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00166056  normal  0.0562711 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 		 639 aa  686    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0942  threonyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 642 aa  637    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484442  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  52.07 
 
 		 640 aa  680    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1638  threonyl-tRNA synthetase  56.14 
 
 		 660 aa  751    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.360122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3225  threonyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 640 aa  679    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.529889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2321  threonyl-tRNA synthetase  55.19 
 
 		 675 aa  726    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.313721 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  54.52 
 
 		 635 aa  723    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0777  threonyl-tRNA synthetase  56.71 
 
 		 654 aa  771    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.795013  normal  0.073481 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0955  threonyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 648 aa  742    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.843203  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 		 638 aa  669    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3487  threonyl-tRNA synthetase  62.75 
 
 		 643 aa  845    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2154  threonyl-tRNA synthetase  55.64 
 
 		 661 aa  743    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 		 635 aa  718    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1035  threonyl-tRNA synthetase  55.39 
 
 		 693 aa  737    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.233676  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2168  threonyl-tRNA synthetase  55.12 
 
 		 661 aa  728    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.762302  normal  0.0294607 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0204  threonyl-tRNA synthetase  81.98 
 
 		 664 aa  1127    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2099  threonyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 635 aa  654    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0006  threonyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 633 aa  672    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.999215  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1098  threonyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 		 648 aa  725    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00129909  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  53.17 
 
 		 669 aa  699    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 636 aa  687    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3121  threonyl-tRNA synthetase  54.28 
 
 		 679 aa  719    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 635 aa  664    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  55.04 
 
 		 635 aa  701    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 		 635 aa  714    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2668  threonyl-tRNA synthetase  62.75 
 
 		 652 aa  875    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.107403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3261  threonyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 687 aa  726    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.565813  normal  0.0408031 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1799  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  48.24 
 
 		 632 aa  644    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302616  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1669  threonyl-tRNA synthetase  56.08 
 
 		 681 aa  742    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115883  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2417  threonyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 		 644 aa  664    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00010604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  53.75 
 
 		 635 aa  717    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18621  threonyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 640 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 		 640 aa  708    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 641 aa  659    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1721  threonyl-tRNA synthetase  57.03 
 
 		 648 aa  778    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0692  threonyl-tRNA synthetase  80.03 
 
 		 667 aa  1109    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.86772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 		 635 aa  714    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 		 640 aa  693    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2499  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 638 aa  637    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0219257  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1007  threonyl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 656 aa  739    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585418  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2859  threonyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 		 639 aa  670    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.248456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2597  threonyl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 645 aa  655    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000186587  hitchhiker  0.000386738 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1415  threonyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 660 aa  657    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000939714  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4525  threonyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 		 659 aa  752    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.082511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1967  threonyl-tRNA synthetase  52.85 
 
 		 640 aa  681    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134711  normal  0.0132251 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 641 aa  689    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1924  threonyl-tRNA synthetase  55.34 
 
 		 675 aa  719    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0331233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5204  threonyl-tRNA synthetase  55.96 
 
 		 688 aa  741    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144339 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  58.05 
 
 		 644 aa  803    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  53.75 
 
 		 635 aa  715    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 640 aa  684    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  54.52 
 
 		 635 aa  723    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 640 aa  685    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 		 635 aa  714    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1888  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  53.32 
 
 		 635 aa  670    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150098 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 		 644 aa  671    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1010  threonyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 		 640 aa  695    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>