More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0692 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1054  threonyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 		 660 aa  695    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290687  normal  0.56724 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 635 aa  692    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2668  threonyl-tRNA synthetase  61.09 
 
 		 652 aa  833    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.107403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  53.02 
 
 		 635 aa  691    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2465  threonyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 640 aa  665    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 641 aa  655    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2746  threonyl-tRNA synthetase  80.03 
 
 		 690 aa  1112    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3089  threonyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 639 aa  646    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.345995  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  53.04 
 
 		 638 aa  679    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3538  threonyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 		 648 aa  685    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.211804 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1577  threonyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 		 635 aa  664    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 635 aa  699    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 635 aa  694    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2211  threonyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 		 666 aa  681    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.920891  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2099  threonyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 635 aa  641    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1071  threonyl-tRNA synthetase  54.59 
 
 		 658 aa  707    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0777  threonyl-tRNA synthetase  55 
 
 		 654 aa  729    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.795013  normal  0.073481 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 640 aa  635    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1638  threonyl-tRNA synthetase  55.57 
 
 		 660 aa  719    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.360122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 635 aa  699    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  53.06 
 
 		 640 aa  689    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1888  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 		 635 aa  654    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150098 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 635 aa  699    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2039  threonyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 646 aa  695    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 635 aa  699    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 		 637 aa  655    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 		 637 aa  652    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 640 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  52.13 
 
 		 638 aa  663    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1845  threonyl-tRNA synthetase  51.05 
 
 		 668 aa  666    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.215697  normal  0.072473 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  53.04 
 
 		 635 aa  696    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01383  threonyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 649 aa  640    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1007  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  53.95 
 
 		 637 aa  660    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.245371  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2035  threonyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 686 aa  712    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  52.51 
 
 		 640 aa  671    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 635 aa  699    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 		 635 aa  689    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 		 635 aa  657    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0385  threonyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 		 646 aa  697    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.752042  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2196  threonyl-tRNA synthetase  57.62 
 
 		 640 aa  753    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.163846  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  52.14 
 
 		 635 aa  694    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10531  threonyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 638 aa  654    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.487806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2219  threonyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 635 aa  635    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00166056  normal  0.0562711 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 635 aa  699    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0955  threonyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 		 648 aa  708    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.843203  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0851  threonyl-tRNA synthetase  54.02 
 
 		 646 aa  711    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1010  threonyl-tRNA synthetase  52.6 
 
 		 640 aa  681    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3225  threonyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 640 aa  662    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.529889 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2368  threonyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 		 644 aa  699    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.642893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4616  threonyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 		 643 aa  662    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213357 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7169  threonyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 		 670 aa  652    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308323  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 638 aa  637    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3487  threonyl-tRNA synthetase  59.58 
 
 		 643 aa  789    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2020  threonyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 635 aa  640    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 635 aa  697    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2154  threonyl-tRNA synthetase  54.59 
 
 		 661 aa  709    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2168  threonyl-tRNA synthetase  53.52 
 
 		 661 aa  702    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.762302  normal  0.0294607 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0204  threonyl-tRNA synthetase  83.31 
 
 		 664 aa  1155    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1745  threonyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 637 aa  635    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239329 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2149  threonyl-tRNA synthetase  55.96 
 
 		 641 aa  724    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1098  threonyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 648 aa  673    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00129909  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 		 669 aa  675    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 		 636 aa  671    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3121  threonyl-tRNA synthetase  54.16 
 
 		 679 aa  694    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 635 aa  659    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  53.44 
 
 		 635 aa  672    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  52.75 
 
 		 635 aa  694    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 644 aa  644    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3261  threonyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 687 aa  705    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.565813  normal  0.0408031 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2276  threonyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 		 675 aa  686    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.644859 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1669  threonyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 		 681 aa  706    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115883  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3025  threonyl-tRNA synthetase  52.43 
 
 		 638 aa  661    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  53.34 
 
 		 635 aa  701    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2598  threonyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 		 675 aa  684    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.311261 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 640 aa  660    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 635 aa  677    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1721  threonyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 		 648 aa  710    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0692  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 667 aa  1371    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.86772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  52.14 
 
 		 635 aa  694    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0641  threonyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 658 aa  676    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3481  threonyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 640 aa  661    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800828  normal  0.0249513 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1007  threonyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 656 aa  699    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585418  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 639 aa  666    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 		 640 aa  667    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1967  threonyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 		 640 aa  665    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134711  normal  0.0132251 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4525  threonyl-tRNA synthetase  56.14 
 
 		 659 aa  734    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.082511 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 641 aa  667    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1924  threonyl-tRNA synthetase  53.92 
 
 		 675 aa  691    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0331233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5204  threonyl-tRNA synthetase  54.74 
 
 		 688 aa  715    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144339 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 		 644 aa  761    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 635 aa  692    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  51.08 
 
 		 640 aa  666    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 635 aa  692    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3886  threonyl-tRNA synthetase  53.75 
 
 		 687 aa  703    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  52.14 
 
 		 635 aa  694    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 635 aa  699    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1035  threonyl-tRNA synthetase  54.44 
 
 		 693 aa  702    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.233676  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6323  threonyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 670 aa  672    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2321  threonyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 		 675 aa  682    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.313721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2859  threonyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 		 639 aa  647    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.248456  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>