More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0204 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_10531  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 638 aa  673    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.487806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2321  threonyl-tRNA synthetase  54.82 
 
 		 675 aa  706    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.313721 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0955  threonyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 648 aa  723    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.843203  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2746  threonyl-tRNA synthetase  81.98 
 
 		 690 aa  1125    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2465  threonyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 		 640 aa  680    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2219  threonyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 635 aa  649    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00166056  normal  0.0562711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 		 640 aa  678    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 		 639 aa  696    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 		 638 aa  699    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0978  threonyl-tRNA synthetase  51.7 
 
 		 633 aa  682    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1577  threonyl-tRNA synthetase  54.74 
 
 		 635 aa  693    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 635 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1888  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  54.26 
 
 		 635 aa  677    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150098 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 635 aa  718    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 644 aa  681    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_004310  BR1071  threonyl-tRNA synthetase  56.41 
 
 		 658 aa  730    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2668  threonyl-tRNA synthetase  61.88 
 
 		 652 aa  842    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.107403  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 640 aa  655    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 635 aa  723    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1415  threonyl-tRNA synthetase  50.69 
 
 		 660 aa  662    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000939714  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3225  threonyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 640 aa  676    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.529889 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 635 aa  723    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0777  threonyl-tRNA synthetase  55.91 
 
 		 654 aa  744    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.795013  normal  0.073481 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1010  threonyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 640 aa  704    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 635 aa  723    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 637 aa  689    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 637 aa  686    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 		 640 aa  654    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2098  threonyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 644 aa  652    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000824061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  53.82 
 
 		 638 aa  685    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0033  threonyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 641 aa  645    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.611945  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  54.57 
 
 		 635 aa  718    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0934  threonyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 633 aa  645    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.026136  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1007  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  55.62 
 
 		 637 aa  692    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.245371  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2035  threonyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 686 aa  704    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 635 aa  723    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 635 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1638  threonyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 		 660 aa  725    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.360122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1931  threonyl-tRNA synthetase  51.19 
 
 		 640 aa  638    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0385  threonyl-tRNA synthetase  53.88 
 
 		 646 aa  717    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.752042  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4616  threonyl-tRNA synthetase  54.44 
 
 		 643 aa  690    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213357 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 635 aa  722    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6323  threonyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 		 670 aa  695    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103626 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0851  threonyl-tRNA synthetase  53.88 
 
 		 646 aa  718    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3089  threonyl-tRNA synthetase  55.18 
 
 		 639 aa  677    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.345995  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3481  threonyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 		 640 aa  678    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800828  normal  0.0249513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4525  threonyl-tRNA synthetase  55.47 
 
 		 659 aa  728    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.082511 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1035  threonyl-tRNA synthetase  56.26 
 
 		 693 aa  726    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.233676  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2597  threonyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 		 645 aa  645    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000186587  hitchhiker  0.000386738 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2020  threonyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 635 aa  660    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2039  threonyl-tRNA synthetase  53.88 
 
 		 646 aa  717    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2154  threonyl-tRNA synthetase  56.41 
 
 		 661 aa  731    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 638 aa  664    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3487  threonyl-tRNA synthetase  61.33 
 
 		 643 aa  818    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 		 635 aa  718    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1054  threonyl-tRNA synthetase  55.37 
 
 		 660 aa  735    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290687  normal  0.56724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2168  threonyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 		 661 aa  708    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.762302  normal  0.0294607 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0204  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 664 aa  1366    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2099  threonyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 		 635 aa  660    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0006  threonyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 		 633 aa  647    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.999215  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1098  threonyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 648 aa  689    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00129909  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  53.64 
 
 		 669 aa  697    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  53.06 
 
 		 636 aa  691    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3121  threonyl-tRNA synthetase  55.07 
 
 		 679 aa  702    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 635 aa  682    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 		 635 aa  690    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 635 aa  720    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1745  threonyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 		 637 aa  670    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239329 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3261  threonyl-tRNA synthetase  53.38 
 
 		 687 aa  704    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.565813  normal  0.0408031 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1799  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  48.7 
 
 		 632 aa  646    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302616  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1669  threonyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 		 681 aa  710    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115883  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2417  threonyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 644 aa  654    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00010604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 		 635 aa  719    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06531  threonyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 640 aa  652    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  55.01 
 
 		 640 aa  714    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2859  threonyl-tRNA synthetase  52.06 
 
 		 639 aa  674    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.248456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1721  threonyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 648 aa  731    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0692  threonyl-tRNA synthetase  83.31 
 
 		 667 aa  1155    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.86772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 635 aa  722    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  52.84 
 
 		 640 aa  678    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2368  threonyl-tRNA synthetase  54.92 
 
 		 644 aa  724    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.642893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1007  threonyl-tRNA synthetase  54.72 
 
 		 656 aa  709    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585418  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0641  threonyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 		 658 aa  700    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5204  threonyl-tRNA synthetase  55.81 
 
 		 688 aa  729    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144339 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1478  threonyl-tRNA synthetase  50.38 
 
 		 660 aa  659    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000148351  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 635 aa  718    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 		 641 aa  700    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1924  threonyl-tRNA synthetase  54.6 
 
 		 675 aa  706    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0331233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1967  threonyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 		 640 aa  682    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134711  normal  0.0132251 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  57.47 
 
 		 644 aa  780    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 635 aa  718    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 		 640 aa  674    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 641 aa  660    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18621  threonyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 640 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  53.95 
 
 		 635 aa  699    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 635 aa  722    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 635 aa  723    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 640 aa  674    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 635 aa  718    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2196  threonyl-tRNA synthetase  59.42 
 
 		 640 aa  777    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.163846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>