245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0533 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  100 
 
 		 207 aa  432  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  77.78 
 
 		 207 aa  351  4e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  54.63 
 
 		 216 aa  248  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2617  uridine kinase  53.43 
 
 		 212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1657  uridine kinase  53.43 
 
 		 212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0722731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1732  uridine kinase  53.43 
 
 		 212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000414727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1762  uridine kinase  53.43 
 
 		 212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0067733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2456  uridine kinase  52.94 
 
 		 212 aa  231  6e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000511378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1888  uridine kinase  52.94 
 
 		 212 aa  231  6e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127737  normal  0.0259304 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2576  uridine kinase  52.94 
 
 		 212 aa  231  6e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0976754  normal  0.0423229 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1979  uridine kinase  52.66 
 
 		 211 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  hitchhiker  0.00165825 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  52.94 
 
 		 212 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2463  uridine kinase  52.94 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000426115  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01972  uridine kinase  53.47 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1591  uridine kinase  53.47 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1166  uridine kinase  53.47 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0994  uridine kinase  53.47 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2359  uridine kinase  53.47 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1575  uridine kinase  53.47 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2206  uridine kinase  53.47 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3003  uridine kinase  53.47 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01961  hypothetical protein  53.47 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2218  uridine kinase  52.94 
 
 		 212 aa  229  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.428302  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3042  uridine kinase  52.97 
 
 		 213 aa  228  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2453  uridine kinase  54.46 
 
 		 213 aa  227  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2552  uridine kinase  54.46 
 
 		 213 aa  227  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3195  uridine kinase  54.46 
 
 		 213 aa  227  8e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0472319  hitchhiker  0.00149984 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2249  uridine kinase  52.48 
 
 		 213 aa  227  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2356  uridine kinase  52.48 
 
 		 213 aa  227  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0747859  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2349  uridine kinase  52.48 
 
 		 213 aa  227  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2463  uridine kinase  52.48 
 
 		 213 aa  227  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.92076  normal  0.601786 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1575  uridine kinase  50.72 
 
 		 211 aa  227  9e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1289  uridine kinase  52.48 
 
 		 213 aa  227  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2871  uridine kinase  52.48 
 
 		 213 aa  226  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2305  uridine kinase  52.48 
 
 		 213 aa  225  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1197  uridine kinase  51.98 
 
 		 213 aa  224  7e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2244  uridine kinase  51.47 
 
 		 212 aa  224  9e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2651  uridine kinase  50.72 
 
 		 211 aa  223  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.212203 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2054  uridine kinase  50.49 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02924  uridine kinase  51.96 
 
 		 213 aa  222  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1489  uridine kinase  53.43 
 
 		 212 aa  222  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0501777  normal  0.122094 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2680  uridine kinase  51.98 
 
 		 213 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1576  uridine kinase  52.48 
 
 		 213 aa  222  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.435743 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2228  uridine kinase  50.98 
 
 		 215 aa  219  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1919  uridine kinase  50.98 
 
 		 211 aa  216  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0556  uridine kinase  52.45 
 
 		 219 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0365333  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002983  uridine kinase (C1)  51.96 
 
 		 213 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.163408  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  46.53 
 
 		 232 aa  204  6e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  46.53 
 
 		 232 aa  204  6e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  43.84 
 
 		 211 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4113  uridine kinase  49.27 
 
 		 212 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0736  uridine kinase  48.78 
 
 		 212 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4124  uridine kinase  49.27 
 
 		 212 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4460  uridine kinase  49.27 
 
 		 212 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0770159 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4500  uridine kinase  48.78 
 
 		 212 aa  187  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0644  uridine kinase  45.83 
 
 		 213 aa  186  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000687916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4276  uridine kinase  49.27 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4608  uridine kinase  49.27 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  45.1 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4462  uridine kinase  48.78 
 
 		 212 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0409991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4513  uridine kinase  48.78 
 
 		 212 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295414  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4227  uridine kinase  48.29 
 
 		 212 aa  185  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1079  uridine kinase  45.54 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  43.2 
 
 		 204 aa  185  4e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0935  uridine kinase  45.54 
 
 		 215 aa  185  5e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2023  uridine kinase  44.17 
 
 		 208 aa  184  6e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3093  uridine kinase  47.8 
 
 		 212 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1385  uridine kinase  42.86 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1781  uridine kinase  42.29 
 
 		 209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  42.86 
 
 		 209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0970  uridine kinase  45.1 
 
 		 211 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1740  uridine kinase  42.72 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.627897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  44.92 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  44.92 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  42.86 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  41.38 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1175  uridine kinase  43.85 
 
 		 207 aa  174  6e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1215  uridine kinase  42.16 
 
 		 218 aa  173  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000175656  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0315  uridine kinase  42.86 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07150  uridine kinase  39.6 
 
 		 202 aa  168  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  37.8 
 
 		 219 aa  168  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1825  uridine kinase  45.15 
 
 		 206 aa  167  8e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3563  uridine kinase  38.54 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.933791  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2200  uridine kinase  43.35 
 
 		 223 aa  165  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0537  uridine kinase  46.02 
 
 		 242 aa  164  5.9999999999999996e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0563702  hitchhiker  0.00000000000000916272 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1033  uridine kinase  44.19 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.12732  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1848  uridine kinase  44.62 
 
 		 220 aa  160  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  41.12 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  39.11 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0453  uridine kinase  45.12 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00211906  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  37.38 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1365  uridine kinase  44.12 
 
 		 204 aa  154  6e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.759935  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0382  uridine kinase  45.15 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0215949  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  36.14 
 
 		 212 aa  152  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1238  uridine kinase  46.51 
 
 		 211 aa  151  8e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2005  uridine kinase  37.5 
 
 		 204 aa  148  5e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.679011  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0826  uridine kinase  45.71 
 
 		 209 aa  148  7e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.362749  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10398  predicted protein  40.12 
 
 		 209 aa  147  8e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296577  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1422  uridine kinase  41.14 
 
 		 236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5127  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.36 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.426663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>