155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3961 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3961  phosphoribulokinase/uridine kinase  100 
 
 
203 aa  418  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.926817 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  34.98 
 
 
219 aa  108  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1575  uridine kinase  31.88 
 
 
211 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2244  uridine kinase  33.02 
 
 
212 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  33.17 
 
 
212 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2651  uridine kinase  32.68 
 
 
211 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.212203 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1979  uridine kinase  32.37 
 
 
211 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  hitchhiker  0.00165825 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1919  uridine kinase  33.17 
 
 
211 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  30.88 
 
 
209 aa  105  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2871  uridine kinase  32.04 
 
 
213 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2305  uridine kinase  32.52 
 
 
213 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01972  uridine kinase  32.52 
 
 
213 aa  101  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1591  uridine kinase  32.52 
 
 
213 aa  101  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01961  hypothetical protein  32.52 
 
 
213 aa  101  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2206  uridine kinase  32.52 
 
 
213 aa  101  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2359  uridine kinase  32.52 
 
 
213 aa  101  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1575  uridine kinase  32.52 
 
 
213 aa  101  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0994  uridine kinase  32.52 
 
 
213 aa  101  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1166  uridine kinase  32.52 
 
 
213 aa  101  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3003  uridine kinase  32.52 
 
 
213 aa  101  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  33.98 
 
 
211 aa  101  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07150  uridine kinase  33.5 
 
 
202 aa  100  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2349  uridine kinase  32.04 
 
 
213 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2356  uridine kinase  32.04 
 
 
213 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0747859  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2249  uridine kinase  32.04 
 
 
213 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2463  uridine kinase  32.04 
 
 
213 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.92076  normal  0.601786 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2680  uridine kinase  31.55 
 
 
213 aa  99.8  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  34.02 
 
 
202 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2453  uridine kinase  31.55 
 
 
213 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02924  uridine kinase  31.55 
 
 
213 aa  99.8  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3195  uridine kinase  31.55 
 
 
213 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0472319  hitchhiker  0.00149984 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2552  uridine kinase  31.55 
 
 
213 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2005  uridine kinase  37.28 
 
 
204 aa  99.4  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.679011  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2054  uridine kinase  31.71 
 
 
212 aa  98.2  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  31.86 
 
 
219 aa  98.2  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0935  uridine kinase  31.4 
 
 
215 aa  98.2  7e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2617  uridine kinase  29.76 
 
 
212 aa  97.8  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1657  uridine kinase  29.76 
 
 
212 aa  97.8  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0722731  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1732  uridine kinase  29.76 
 
 
212 aa  97.8  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000414727  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1762  uridine kinase  29.76 
 
 
212 aa  97.8  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0067733  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1489  uridine kinase  30.58 
 
 
212 aa  97.1  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0501777  normal  0.122094 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2456  uridine kinase  29.95 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000511378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1888  uridine kinase  29.95 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127737  normal  0.0259304 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2576  uridine kinase  29.95 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0976754  normal  0.0423229 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  32.04 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2218  uridine kinase  29.47 
 
 
212 aa  96.7  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.428302  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1576  uridine kinase  30.1 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.435743 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1079  uridine kinase  30.92 
 
 
215 aa  96.3  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02150  uridine kinase, putative  33.81 
 
 
582 aa  96.3  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1289  uridine kinase  30.58 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2463  uridine kinase  29.47 
 
 
212 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000426115  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  31.4 
 
 
504 aa  95.1  6e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2228  uridine kinase  30.1 
 
 
215 aa  95.1  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  32.29 
 
 
212 aa  94.7  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3042  uridine kinase  30.1 
 
 
213 aa  94.7  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1385  uridine kinase  32.79 
 
 
209 aa  95.1  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1197  uridine kinase  29.13 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1033  uridine kinase  34.68 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.12732  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1175  uridine kinase  32.98 
 
 
207 aa  94  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002983  uridine kinase (C1)  31.55 
 
 
213 aa  92.8  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.163408  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  30.98 
 
 
232 aa  92  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1781  uridine kinase  30.05 
 
 
209 aa  92  6e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  30.43 
 
 
232 aa  91.7  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0556  uridine kinase  30.92 
 
 
219 aa  90.5  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0365333  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  29.3 
 
 
209 aa  89  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0315  uridine kinase  31.32 
 
 
214 aa  87  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  30.05 
 
 
216 aa  86.3  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  30.85 
 
 
204 aa  85.9  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1215  uridine kinase  31.55 
 
 
218 aa  85.1  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000175656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0970  uridine kinase  32.85 
 
 
211 aa  84.7  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  31.53 
 
 
207 aa  84.7  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0644  uridine kinase  29.08 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000687916  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  27.94 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  31.11 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  31.11 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1422  uridine kinase  29.94 
 
 
236 aa  82  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3563  uridine kinase  30.93 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.933791  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5127  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.08 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.426663  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3093  uridine kinase  31.67 
 
 
212 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0015  uridine kinase  30.85 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2023  uridine kinase  33.55 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1740  uridine kinase  31.95 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.627897  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_47740  predicted protein  31.61 
 
 
434 aa  75.9  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0678521  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  29.56 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1848  uridine kinase  32.8 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10398  predicted protein  30.48 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296577  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4462  uridine kinase  30.56 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0409991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4513  uridine kinase  30.56 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0736  uridine kinase  30 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0115  uridine kinase  27.91 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.54495 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4500  uridine kinase  30 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4460  uridine kinase  30 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0770159 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4113  uridine kinase  30 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4124  uridine kinase  30 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  30.32 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4227  uridine kinase  29.44 
 
 
212 aa  72  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4276  uridine kinase  30 
 
 
212 aa  72  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4608  uridine kinase  30 
 
 
212 aa  72  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4546  phosphoribulokinase/uridine kinase  29.41 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3054  uridine kinase  31.29 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.654412  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>